92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3420 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  98.93 
 
 		 559 aa  1106    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  100 
 
 		 559 aa  1115    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  100 
 
 		 559 aa  1115    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2290  lytic transglycosylase, catalytic  67.98 
 
 		 253 aa  362  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4376  lytic transglycosylase, catalytic  69.96 
 
 		 313 aa  360  4e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.31469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4377  hypothetical protein  64.85 
 
 		 258 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2289  hypothetical protein  64.29 
 
 		 220 aa  292  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.870625  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6651  hypothetical protein  49.22 
 
 		 283 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000122053 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1951  hypothetical protein  52.94 
 
 		 264 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2285  putative lipoprotein  52.45 
 
 		 264 aa  244  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1841  putative lipoprotein  52.45 
 
 		 264 aa  242  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1409  hypothetical protein  47.19 
 
 		 281 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0211733  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4863  hypothetical protein  53.81 
 
 		 266 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  hitchhiker  0.000146739 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4347  hypothetical protein  52.86 
 
 		 301 aa  236  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000585573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1360  hypothetical protein  49.34 
 
 		 278 aa  235  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  45.31 
 
 		 355 aa  229  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  40 
 
 		 331 aa  226  7e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  45.85 
 
 		 334 aa  223  7e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3370  putative inner membrane protein  51.47 
 
 		 266 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3191  putative inner membrane protein  50.98 
 
 		 266 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3270  hypothetical protein  50.98 
 
 		 266 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0947  putative lipoprotein  49.5 
 
 		 275 aa  211  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3203  hypothetical protein  50.49 
 
 		 266 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.637213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  36.71 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  45.53 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  41.91 
 
 		 906 aa  89  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  44.74 
 
 		 366 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2885  protein of unknown function DUF1460  32.1 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  43.9 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 378 aa  83.2  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  42.73 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  41.27 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  42.75 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  41.12 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  37.34 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  46.23 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1802  Lytic transglycosylase catalytic  44.55 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187771  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  36.43 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  45.54 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2759  protein of unknown function DUF1460  28.07 
 
 		 272 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4429  hypothetical protein  25.63 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0456989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4224  protein of unknown function DUF1460  25.11 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.10408  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4185  protein of unknown function DUF1460  25.11 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  32.43 
 
 		 352 aa  66.6  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  38.74 
 
 		 844 aa  62.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  32.1 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  32.1 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  32.1 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  34.11 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.57 
 
 		 362 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2334  protein of unknown function DUF1460  26.4 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  31.01 
 
 		 381 aa  57  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  32.26 
 
 		 447 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  34.87 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  30.92 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  44.21 
 
 		 377 aa  55.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  40.51 
 
 		 233 aa  53.5  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  30.12 
 
 		 439 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  24.86 
 
 		 1048 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0669  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.21 
 
 		 314 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  33.86 
 
 		 541 aa  51.6  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3317  hypothetical protein  24.88 
 
 		 312 aa  51.6  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  43.66 
 
 		 453 aa  50.4  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  38.67 
 
 		 298 aa  50.4  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  32.06 
 
 		 417 aa  47.4  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  33.98 
 
 		 282 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  45.07 
 
 		 506 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  38.14 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  39.08 
 
 		 251 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4021  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  43.66 
 
 		 289 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0202993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.66 
 
 		 662 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  37.33 
 
 		 259 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  37.33 
 
 		 259 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  43.48 
 
 		 300 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  33.33 
 
 		 174 aa  45.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  28.67 
 
 		 390 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  38.27 
 
 		 242 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  38.27 
 
 		 242 aa  45.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  35.79 
 
 		 241 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2287  phage internal core protein  37.5 
 
 		 1569 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  37.93 
 
 		 260 aa  44.3  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  38.67 
 
 		 272 aa  43.9  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  38.89 
 
 		 254 aa  43.9  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  34.29 
 
 		 254 aa  43.9  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  46.48 
 
 		 318 aa  43.9  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  37.93 
 
 		 260 aa  43.9  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  36.59 
 
 		 249 aa  43.5  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  34.15 
 
 		 258 aa  43.5  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0853  lytic murein transglycosylase B  28.3 
 
 		 336 aa  43.5  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114292  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  36 
 
 		 254 aa  43.5  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>