238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3208 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 387 aa  744    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  51.12 
 
 		 378 aa  146  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  47.41 
 
 		 429 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  58.04 
 
 		 366 aa  116  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  49.07 
 
 		 906 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  52.03 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  49.18 
 
 		 349 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  42.2 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  46.55 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  51.52 
 
 		 844 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  44.9 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  55.37 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  45.16 
 
 		 290 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.68 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  47.69 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  48.67 
 
 		 352 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  49.56 
 
 		 355 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  47.5 
 
 		 331 aa  87.8  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  44.53 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  36.91 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1802  Lytic transglycosylase catalytic  51.28 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187771  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  45.54 
 
 		 559 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  45.54 
 
 		 559 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  44.62 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  45.54 
 
 		 559 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  39.33 
 
 		 541 aa  80.1  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  38.57 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  39.69 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  38.19 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  38.35 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  37.96 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  39.29 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2290  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  36.69 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  37.95 
 
 		 466 aa  69.7  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4376  lytic transglycosylase, catalytic  40.91 
 
 		 313 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.31469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  36.99 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  41.26 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  34.29 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  37.41 
 
 		 275 aa  67  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  35.62 
 
 		 439 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  32.5 
 
 		 506 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  35.14 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  34.25 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  34.25 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  34.25 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  34.01 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  35.25 
 
 		 662 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  37.04 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  34.48 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  43.37 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3478  lytic transglycosylase  41.18 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  43.21 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  35 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2993  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  43.53 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3035  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  43.53 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1103  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  32.91 
 
 		 815 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.792385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  32.08 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  34.27 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  33.08 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  43.75 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  44.58 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  44.58 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11040  lipoprotein lpqU  32.86 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0349863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  32.14 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  32.14 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  32.14 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5874  hypothetical protein  44 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.030306  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  48.98 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5352  putative lipoprotein LpqU  43.75 
 
 		 212 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  33.57 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3330  murein hydrolase B  45 
 
 		 381 aa  55.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  28.37 
 
 		 1048 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1251  hypothetical protein  37.67 
 
 		 546 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0850  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  39.36 
 
 		 275 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  48.98 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  30.82 
 
 		 249 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1953  putative lipoprotein LpqU  43.59 
 
 		 249 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0514713  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2285  transglycosylase domain-containing protein  37.65 
 
 		 349 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1267  lytic transglycosylase catalytic  40.62 
 
 		 176 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4021  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  33.58 
 
 		 289 aa  53.1  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0202993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  36.78 
 
 		 351 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000590482  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3237  murein hydrolase B  46.94 
 
 		 383 aa  52.8  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1944  lytic murein transglycosylase  56 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.723266  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  51.02 
 
 		 445 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2099  lytic murein transglycosylase B  54 
 
 		 365 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1254  lytic murein transglycosylase  54.1 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.300933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2708  murein hydrolase B  48.98 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102119  hitchhiker  0.00940641 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0389  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  36.36 
 
 		 299 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3140  murein hydrolase B  41.56 
 
 		 359 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2951  murein hydrolase B  41.56 
 
 		 359 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1351  murein hydrolase B  48.98 
 
 		 364 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.720495  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  52 
 
 		 481 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  37.97 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3017  murein hydrolase B  41.56 
 
 		 359 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  hitchhiker  0.00000130232 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3033  murein hydrolase B  41.56 
 
 		 359 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.986861  hitchhiker  0.00384978 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1464  murein hydrolase B  48.98 
 
 		 364 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3179  murein hydrolase B  41.27 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02516  hypothetical protein  42.68 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.360268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3176  murein hydrolase B  42.68 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.417908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>