248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1666 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
906 aa  1817    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  39.04 
 
 
346 aa  137  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  46.15 
 
 
290 aa  129  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  54.14 
 
 
362 aa  123  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  49.61 
 
 
378 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  52.17 
 
 
400 aa  115  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  31.23 
 
 
352 aa  111  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  45.31 
 
 
366 aa  106  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  44 
 
 
429 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  44.36 
 
 
381 aa  103  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  44.27 
 
 
349 aa  102  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  44.8 
 
 
352 aa  100  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  45.05 
 
 
354 aa  99.4  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  41.27 
 
 
541 aa  97.8  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  49.07 
 
 
387 aa  96.3  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  44.12 
 
 
844 aa  95.1  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4376  lytic transglycosylase, catalytic  45.08 
 
 
313 aa  94  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.31469  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  46.53 
 
 
308 aa  93.2  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.43 
 
 
390 aa  91.7  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  39.57 
 
 
334 aa  90.5  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.98 
 
 
362 aa  89.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  43.44 
 
 
559 aa  88.2  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  41.91 
 
 
559 aa  87.8  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  41.91 
 
 
559 aa  87.8  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  42.11 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2290  lytic transglycosylase, catalytic  43.22 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  43.36 
 
 
308 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.99 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  25.67 
 
 
1048 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  30.86 
 
 
377 aa  77.4  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1802  Lytic transglycosylase catalytic  53.26 
 
 
384 aa  77  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187771  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  37.01 
 
 
392 aa  73.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  40.8 
 
 
302 aa  70.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  32.28 
 
 
506 aa  70.5  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  27.59 
 
 
434 aa  69.7  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  40.95 
 
 
417 aa  70.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2993  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  44.16 
 
 
336 aa  69.7  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3035  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  44.16 
 
 
336 aa  69.7  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5874  hypothetical protein  51.47 
 
 
263 aa  68.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.030306  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  30.36 
 
 
662 aa  68.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  34.48 
 
 
423 aa  67.4  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  37.6 
 
 
327 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1267  lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 
176 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  30.15 
 
 
453 aa  66.6  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  36 
 
 
331 aa  63.9  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0100  hypothetical protein  30 
 
 
483 aa  62.4  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  32.78 
 
 
447 aa  62  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  27.54 
 
 
389 aa  61.6  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3478  lytic transglycosylase  34.51 
 
 
175 aa  61.6  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0850  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  42.86 
 
 
275 aa  61.2  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  32.91 
 
 
439 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1251  hypothetical protein  32.19 
 
 
546 aa  60.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  28.26 
 
 
216 aa  59.3  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  42.47 
 
 
411 aa  59.7  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1558  lytic murein transglycosylase B  44.44 
 
 
372 aa  59.7  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000667171  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0935  peptidase M23B  24.8 
 
 
598 aa  59.3  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  46.58 
 
 
242 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  34.48 
 
 
411 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  46.58 
 
 
242 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  42.25 
 
 
251 aa  58.5  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  43.84 
 
 
242 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3017  murein hydrolase B  52.83 
 
 
359 aa  58.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  hitchhiker  0.00000130232 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2951  murein hydrolase B  52.83 
 
 
359 aa  58.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3033  murein hydrolase B  52.83 
 
 
359 aa  58.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.986861  hitchhiker  0.00384978 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3191  hypothetical protein  40.85 
 
 
241 aa  58.2  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3140  murein hydrolase B  52.83 
 
 
359 aa  58.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011218 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.66 
 
 
267 aa  57.8  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  29.56 
 
 
443 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4021  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  47.22 
 
 
289 aa  57.4  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0202993  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  43.84 
 
 
242 aa  57  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  29.56 
 
 
443 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  29.56 
 
 
443 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0988  lytic murein transglycosylase B  44.29 
 
 
361 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2837  murein hydrolase B  44.29 
 
 
361 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.359796  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3330  murein hydrolase B  43.55 
 
 
381 aa  57  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  43.66 
 
 
252 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  43.66 
 
 
252 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  44.78 
 
 
249 aa  56.6  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  43.66 
 
 
252 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.295293 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02551  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  44.29 
 
 
361 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3948  murein hydrolase B  44.29 
 
 
361 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315849  normal  0.782651 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2682  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  37.5 
 
 
423 aa  55.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342063 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2824  murein hydrolase B  44.29 
 
 
361 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0997605  hitchhiker  0.00000822387 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  44.44 
 
 
252 aa  56.2  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5352  putative lipoprotein LpqU  43.84 
 
 
212 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.75 
 
 
275 aa  56.2  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1011  murein hydrolase B  44.29 
 
 
361 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000289241 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2985  murein hydrolase B  44.29 
 
 
361 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.26128  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02516  hypothetical protein  44.29 
 
 
361 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.360268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3176  murein hydrolase B  44.29 
 
 
361 aa  56.2  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.417908  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2982  murein hydrolase B  50.94 
 
 
359 aa  55.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000956693 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3399  murein hydrolase B  51.92 
 
 
361 aa  55.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3179  murein hydrolase B  47.76 
 
 
382 aa  55.8  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  38.46 
 
 
282 aa  55.5  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3237  murein hydrolase B  41.94 
 
 
383 aa  55.1  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  34.91 
 
 
370 aa  55.1  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2077  lytic murein transglycosylase B  50.85 
 
 
390 aa  54.7  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0554951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  28.37 
 
 
466 aa  53.9  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1360  Peptidase M23  25 
 
 
348 aa  53.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2285  transglycosylase domain-containing protein  38.96 
 
 
349 aa  53.5  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>