277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1802 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1802  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 384 aa  714    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187771  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  62.28 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  57.63 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  54.74 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  58.18 
 
 		 366 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  57.02 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  45.65 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  53.26 
 
 		 906 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  54 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  44 
 
 		 331 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  46.83 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  52.68 
 
 		 387 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  39.33 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  40.71 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  41.6 
 
 		 327 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  48.11 
 
 		 559 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  45.45 
 
 		 559 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  45.45 
 
 		 559 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  40.14 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  42.42 
 
 		 844 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  35.06 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4376  lytic transglycosylase, catalytic  40.91 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.31469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  36.42 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  47.17 
 
 		 352 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  33.54 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2290  lytic transglycosylase, catalytic  39.09 
 
 		 253 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  44.12 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  36.6 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  43.14 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  32.92 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  44.12 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  43.82 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  29.79 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  44.71 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  35.92 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  37.21 
 
 		 662 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  41.67 
 
 		 541 aa  67  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2682  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  44.58 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342063 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  37.7 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  55.32 
 
 		 362 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  31.21 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  36.84 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  36.36 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  36.36 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  36.36 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  42.11 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  42.27 
 
 		 242 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  44.44 
 
 		 470 aa  62  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  34.88 
 
 		 506 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2993  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  40.48 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3035  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  40.48 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0389  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  36.19 
 
 		 299 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  34.29 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  43.66 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  34.33 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  37.08 
 
 		 682 aa  60.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  42.42 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  42.86 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  42.86 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  43.37 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  36.9 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000590482  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  55.56 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  44.78 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2285  transglycosylase domain-containing protein  43.37 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  47.37 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  39.13 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  46.99 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3675  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 271 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0850  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  41.38 
 
 		 275 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3237  murein hydrolase B  53.06 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  47.06 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3399  murein hydrolase B  52.83 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  30.12 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  39.13 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  46.91 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3330  murein hydrolase B  53.06 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  40.74 
 
 		 251 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  44.74 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  44 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0869  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  41.86 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.627939  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  42.67 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  42.71 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3179  murein hydrolase B  50.94 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  42.67 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  42.67 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  35.53 
 
 		 392 aa  57  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3033  murein hydrolase B  50.94 
 
 		 359 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.986861  hitchhiker  0.00384978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2951  murein hydrolase B  50.94 
 
 		 359 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3017  murein hydrolase B  50.94 
 
 		 359 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  hitchhiker  0.00000130232 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3140  murein hydrolase B  50.94 
 
 		 359 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011218 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5352  putative lipoprotein LpqU  43.37 
 
 		 212 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02516  hypothetical protein  50.94 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.360268  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1953  putative lipoprotein LpqU  44 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0514713  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3448  lytic murein transglycosylase B  45.71 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  50.7 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2824  murein hydrolase B  50.94 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0997605  hitchhiker  0.00000822387 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0977  murein hydrolase B  50.94 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  42.86 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  47.5 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>