More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1690 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 378 aa  759    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  45.43 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  51.17 
 
 		 366 aa  273  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  64.35 
 
 		 400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  58.33 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  63.03 
 
 		 387 aa  126  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1802  Lytic transglycosylase catalytic  58.77 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187771  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  52.94 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  50.39 
 
 		 906 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.52 
 
 		 390 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  53.85 
 
 		 290 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  51.18 
 
 		 844 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  52.07 
 
 		 308 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  48.8 
 
 		 349 aa  106  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  32.06 
 
 		 438 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  45.31 
 
 		 331 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  38.95 
 
 		 447 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  36.84 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.61 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  44.19 
 
 		 302 aa  94  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  45.07 
 
 		 352 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  44.53 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  38.96 
 
 		 282 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  37.58 
 
 		 352 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  30.04 
 
 		 393 aa  90.9  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  35.09 
 
 		 443 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  35.09 
 
 		 443 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  35.03 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  35.09 
 
 		 443 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  39.29 
 
 		 453 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4376  lytic transglycosylase, catalytic  45.76 
 
 		 313 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.31469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  40.14 
 
 		 377 aa  87  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  43.64 
 
 		 331 aa  87  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.99 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  35.37 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  36.53 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  38.03 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  43.48 
 
 		 559 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  42.76 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  40 
 
 		 559 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  40 
 
 		 559 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  35.62 
 
 		 417 aa  83.2  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  34.86 
 
 		 662 aa  82.8  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  40.5 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  37.74 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2290  lytic transglycosylase, catalytic  43.1 
 
 		 253 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  56.44 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  31.87 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0850  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  33.33 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.33 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  40 
 
 		 466 aa  79.7  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0362  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  35.29 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  37.12 
 
 		 249 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  35.09 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  38.46 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  35.09 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  35.09 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  36.48 
 
 		 506 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  33.75 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0432  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  35.29 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288909  hitchhiker  0.00015802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1103  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  35.19 
 
 		 815 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.792385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  33.33 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1953  putative lipoprotein LpqU  31.37 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0514713  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  38.66 
 
 		 541 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  46.59 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  35.66 
 
 		 275 aa  72  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5874  hypothetical protein  48.65 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.030306  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  32.75 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3191  hypothetical protein  30.97 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  35.21 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  36.03 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  28.07 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1251  hypothetical protein  38.36 
 
 		 546 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  34.46 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  33.33 
 
 		 242 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  34 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  34 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0669  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  31.72 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  33.1 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11040  lipoprotein lpqU  34.03 
 
 		 243 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0349863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  28.19 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2993  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  45 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3035  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  45 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5352  putative lipoprotein LpqU  33.78 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  39.08 
 
 		 682 aa  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2682  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  42.17 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1267  lytic transglycosylase catalytic  61.36 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0128  hypothetical protein  26.83 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1010  lytic murein transglycosylase B  58 
 
 		 327 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3478  lytic transglycosylase  36.89 
 
 		 175 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0389  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  29.78 
 
 		 299 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0869  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  41.46 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.627939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57730  murein hydrolase B  50.91 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4021  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  33.82 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0202993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5017  murein hydrolase B  50.91 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3675  lytic murein transglycosylase  41.38 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3339  Zn-finger, DksA/TraR C4 type  59.18 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917071  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  32.14 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2285  transglycosylase domain-containing protein  37.5 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>