39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0128 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0128  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  870    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1882  Lytic transglycosylase catalytic  39.13 
 
 		 715 aa  76.3  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  31.9 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  34.64 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  28.03 
 
 		 438 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2317  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  31.4 
 
 		 672 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  43.88 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  46.99 
 
 		 256 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1692  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.81 
 
 		 664 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3317  hypothetical protein  42.86 
 
 		 254 aa  62  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6086  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.56 
 
 		 260 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2886  hypothetical protein  36.25 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0811534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 666 aa  60.1  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  34.29 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  26.83 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  38.03 
 
 		 671 aa  60.1  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  39.44 
 
 		 657 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0638  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  30.38 
 
 		 687 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1984  hypothetical protein  27.11 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00235757  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1440  hypothetical protein  42.11 
 
 		 280 aa  53.9  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.159115  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  37.84 
 
 		 646 aa  52.4  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  31.75 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  26.67 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5526  hypothetical protein  32.74 
 
 		 148 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000157095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3642  hypothetical protein  34.78 
 
 		 597 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1699  hypothetical protein  44.64 
 
 		 243 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32550  hypothetical protein  44.29 
 
 		 218 aa  50.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.782691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1633  hypothetical protein  32.52 
 
 		 300 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.631294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2781  hypothetical protein  35.29 
 
 		 246 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.302507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1811  hypothetical protein  34.62 
 
 		 263 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1765  hypothetical protein  28.49 
 
 		 266 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0173701  normal  0.140706 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  42.03 
 
 		 168 aa  45.8  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05800  hypothetical protein  35.96 
 
 		 299 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4178  hypothetical protein  34.52 
 
 		 358 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0714985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3135  hypothetical protein  35.62 
 
 		 282 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.308611  normal  0.0523709 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3491  hypothetical protein  35.62 
 
 		 282 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.599157  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3336  hypothetical protein  28.17 
 
 		 266 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.986387  normal  0.0446379 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.21 
 
 		 260 aa  43.5  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>