37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3317 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3317  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  524  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  91.41 
 
 		 256 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  73.15 
 
 		 257 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  48.68 
 
 		 166 aa  145  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  36.53 
 
 		 168 aa  91.3  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  33.94 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1882  Lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 		 715 aa  75.1  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0128  hypothetical protein  42.86 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6086  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.65 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0638  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  34.93 
 
 		 687 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2050  hypothetical protein  29.41 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247709  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1762  hypothetical protein  29.63 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1765  hypothetical protein  31.58 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0173701  normal  0.140706 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3377  hypothetical protein  29.41 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32550  hypothetical protein  36.51 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.782691 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3636  hypothetical protein  29.41 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4178  hypothetical protein  34.51 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0714985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  29.61 
 
 		 666 aa  53.9  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3760  hypothetical protein  28.1 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2328  hypothetical protein  35.71 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4672  hypothetical protein  28.57 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2991  hypothetical protein  28.21 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.570088  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2696  hypothetical protein  26.79 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  27.78 
 
 		 657 aa  49.7  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.17 
 
 		 667 aa  48.9  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2415  hypothetical protein  25.16 
 
 		 358 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1996  hypothetical protein  28.26 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.242655 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2731  hypothetical protein  34.44 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.342321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2687  hypothetical protein  34.44 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  28.28 
 
 		 671 aa  45.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2717  hypothetical protein  34.44 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122181  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3642  hypothetical protein  35.29 
 
 		 597 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1699  hypothetical protein  36.78 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1692  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.43 
 
 		 664 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5526  hypothetical protein  38.16 
 
 		 148 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000157095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0828  hypothetical protein  26.21 
 
 		 292 aa  42.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0189  hypothetical protein  31.78 
 
 		 242 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>