44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4672 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4672  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2415  hypothetical protein  57.53 
 
 		 358 aa  223  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2717  hypothetical protein  58.24 
 
 		 267 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122181  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2731  hypothetical protein  58.24 
 
 		 267 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.342321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2687  hypothetical protein  58.24 
 
 		 267 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5138  hypothetical protein  58.33 
 
 		 231 aa  217  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0828  hypothetical protein  51.94 
 
 		 292 aa  211  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1198  hypothetical protein  53.85 
 
 		 242 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0189  hypothetical protein  47.72 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0113  hypothetical protein  52.48 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  42.08 
 
 		 324 aa  177  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0134  hypothetical protein  49.5 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2696  hypothetical protein  43.11 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05800  hypothetical protein  43 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5524  putative cytoplasmic protein  48.81 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  39.91 
 
 		 503 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  38.5 
 
 		 503 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2669  hypothetical protein  45.61 
 
 		 283 aa  145  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.526313  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0464  hypothetical protein  46.78 
 
 		 286 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000209316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1413  hypothetical protein  46.78 
 
 		 286 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.430861  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0695  hypothetical protein  46.78 
 
 		 286 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0888  hypothetical protein  46.78 
 
 		 286 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0430779  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1650  hypothetical protein  46.2 
 
 		 286 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1806  hypothetical protein  46.2 
 
 		 283 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1629  hypothetical protein  46.2 
 
 		 286 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0613071  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0268  hypothetical protein  39.64 
 
 		 301 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0217918  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1282  Ig domain-containing protein  44.78 
 
 		 465 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.592505  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  29.93 
 
 		 257 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3317  hypothetical protein  28.57 
 
 		 254 aa  52  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  28.57 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  26.09 
 
 		 166 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.71 
 
 		 667 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2612  hypothetical protein  29.22 
 
 		 390 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2050  hypothetical protein  43.1 
 
 		 269 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247709  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  34.09 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  34.09 
 
 		 168 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1633  hypothetical protein  38.46 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.631294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3636  hypothetical protein  37.14 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  32.98 
 
 		 646 aa  42.7  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  30.43 
 
 		 657 aa  42  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1811  hypothetical protein  33.71 
 
 		 263 aa  41.6  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.78 
 
 		 224 aa  42  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1400  hypothetical protein  34.83 
 
 		 351 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3760  hypothetical protein  39.66 
 
 		 269 aa  41.6  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>