33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0189 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0189  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  493  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0113  hypothetical protein  65.88 
 
 		 252 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0134  hypothetical protein  55.24 
 
 		 247 aa  229  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2415  hypothetical protein  55.91 
 
 		 358 aa  226  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4672  hypothetical protein  48.91 
 
 		 214 aa  191  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0828  hypothetical protein  46.95 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1198  hypothetical protein  44.3 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5138  hypothetical protein  46.7 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2687  hypothetical protein  44.2 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2731  hypothetical protein  44.2 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.342321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2717  hypothetical protein  44.2 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122181  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  34.85 
 
 		 324 aa  152  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2696  hypothetical protein  40 
 
 		 208 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5524  putative cytoplasmic protein  41.36 
 
 		 196 aa  138  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05800  hypothetical protein  36.32 
 
 		 299 aa  135  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  34.09 
 
 		 503 aa  135  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  36.2 
 
 		 503 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1650  hypothetical protein  44.19 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1806  hypothetical protein  44.19 
 
 		 283 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1629  hypothetical protein  44.19 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0613071  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0695  hypothetical protein  43.6 
 
 		 286 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0888  hypothetical protein  43.6 
 
 		 286 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0430779  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0464  hypothetical protein  43.6 
 
 		 286 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000209316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1413  hypothetical protein  43.6 
 
 		 286 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.430861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2669  hypothetical protein  42.29 
 
 		 283 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.526313  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0268  hypothetical protein  38.01 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0217918  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1282  Ig domain-containing protein  38.1 
 
 		 465 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.592505  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.65 
 
 		 667 aa  58.5  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  26.45 
 
 		 166 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  32.41 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2050  hypothetical protein  42.31 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247709  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  33.33 
 
 		 179 aa  42.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  31.48 
 
 		 257 aa  41.6  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>