27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2050 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2050  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  544  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247709  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3760  hypothetical protein  94.8 
 
 
269 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3377  hypothetical protein  95.54 
 
 
269 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479611  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3636  hypothetical protein  94.42 
 
 
269 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1626  hypothetical protein  94.05 
 
 
269 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3336  hypothetical protein  81.95 
 
 
266 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.986387  normal  0.0446379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1765  hypothetical protein  75.95 
 
 
266 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0173701  normal  0.140706 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3617  hypothetical protein  96.12 
 
 
103 aa  208  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1762  hypothetical protein  39.72 
 
 
270 aa  182  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2991  hypothetical protein  37.59 
 
 
271 aa  171  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.570088  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1996  hypothetical protein  43.15 
 
 
197 aa  168  9e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  41.94 
 
 
168 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  40.32 
 
 
179 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  31.85 
 
 
257 aa  62.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3317  hypothetical protein  29.41 
 
 
254 aa  59.3  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  30.92 
 
 
256 aa  59.3  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5526  hypothetical protein  34.86 
 
 
148 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000157095  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  29.1 
 
 
166 aa  53.1  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0268  hypothetical protein  35.8 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0217918  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3064  hypothetical protein  88.89 
 
 
81 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  28.57 
 
 
324 aa  49.3  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2682  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.18 
 
 
328 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4672  hypothetical protein  43.1 
 
 
214 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.08 
 
 
391 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2669  hypothetical protein  34.88 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.526313  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0828  hypothetical protein  30.84 
 
 
292 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0189  hypothetical protein  42.31 
 
 
242 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>