25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2991 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2991  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  559  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.570088  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1762  hypothetical protein  48.89 
 
 
270 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1765  hypothetical protein  38.66 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0173701  normal  0.140706 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3336  hypothetical protein  37.92 
 
 
266 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.986387  normal  0.0446379 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3760  hypothetical protein  37.97 
 
 
269 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3377  hypothetical protein  38.72 
 
 
269 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479611  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2050  hypothetical protein  37.59 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247709  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3636  hypothetical protein  37.64 
 
 
269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1626  hypothetical protein  37.97 
 
 
269 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1996  hypothetical protein  41.78 
 
 
197 aa  158  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242655 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3617  hypothetical protein  54.46 
 
 
103 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  31.98 
 
 
179 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  30.25 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  30.99 
 
 
168 aa  56.6  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5526  hypothetical protein  36.9 
 
 
148 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000157095  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  28.36 
 
 
256 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3317  hypothetical protein  28.21 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  24.14 
 
 
166 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2669  hypothetical protein  46.43 
 
 
283 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.526313  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0464  hypothetical protein  41.51 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000209316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1413  hypothetical protein  41.51 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.430861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1650  hypothetical protein  41.51 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0695  hypothetical protein  41.51 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1806  hypothetical protein  41.51 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0888  hypothetical protein  41.51 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0430779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>