20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1762 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1762  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  547  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2991  hypothetical protein  48.89 
 
 
271 aa  270  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.570088  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1765  hypothetical protein  41.39 
 
 
266 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0173701  normal  0.140706 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3336  hypothetical protein  40.07 
 
 
266 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.986387  normal  0.0446379 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3760  hypothetical protein  39.37 
 
 
269 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3377  hypothetical protein  40.29 
 
 
269 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479611  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3636  hypothetical protein  40.29 
 
 
269 aa  175  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2050  hypothetical protein  39.02 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247709  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1626  hypothetical protein  39.57 
 
 
269 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1996  hypothetical protein  40.31 
 
 
197 aa  145  8.000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242655 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3617  hypothetical protein  53.92 
 
 
103 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  33.33 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  32.35 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  36.67 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3317  hypothetical protein  29.63 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  30.37 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5526  hypothetical protein  31.4 
 
 
148 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000157095  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2250  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2669  hypothetical protein  52.27 
 
 
283 aa  46.2  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.526313  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1629  hypothetical protein  50 
 
 
286 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0613071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>