19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1996 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1996  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  413  9.999999999999999e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242655 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3636  hypothetical protein  43.84 
 
 
269 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3377  hypothetical protein  42.86 
 
 
269 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479611  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2050  hypothetical protein  43.15 
 
 
269 aa  167  8e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247709  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1626  hypothetical protein  42.86 
 
 
269 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3760  hypothetical protein  43.15 
 
 
269 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3336  hypothetical protein  43.15 
 
 
266 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.986387  normal  0.0446379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1765  hypothetical protein  40.87 
 
 
266 aa  160  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0173701  normal  0.140706 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2991  hypothetical protein  41.78 
 
 
271 aa  158  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.570088  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1762  hypothetical protein  40.31 
 
 
270 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3617  hypothetical protein  53.4 
 
 
103 aa  121  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  34.35 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  30.81 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  31.62 
 
 
166 aa  55.8  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  28.99 
 
 
257 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3317  hypothetical protein  28.26 
 
 
254 aa  48.5  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5526  hypothetical protein  35.92 
 
 
148 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000157095  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  28.26 
 
 
256 aa  45.1  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5138  hypothetical protein  28.35 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>