23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3636 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3636  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  543  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3760  hypothetical protein  93.68 
 
 
269 aa  511  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3377  hypothetical protein  93.68 
 
 
269 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479611  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2050  hypothetical protein  94.42 
 
 
269 aa  497  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247709  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1626  hypothetical protein  91.45 
 
 
269 aa  487  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3336  hypothetical protein  80.45 
 
 
266 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.986387  normal  0.0446379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1765  hypothetical protein  73.31 
 
 
266 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0173701  normal  0.140706 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3617  hypothetical protein  98.06 
 
 
103 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1762  hypothetical protein  40.29 
 
 
270 aa  179  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1996  hypothetical protein  43.84 
 
 
197 aa  170  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2991  hypothetical protein  38.75 
 
 
271 aa  170  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.570088  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  42.74 
 
 
168 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  38.37 
 
 
179 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  31.85 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3317  hypothetical protein  29.41 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  30.07 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5526  hypothetical protein  45.9 
 
 
148 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000157095  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  26.87 
 
 
166 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  25.48 
 
 
324 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3064  hypothetical protein  81.48 
 
 
81 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0268  hypothetical protein  51.35 
 
 
301 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0217918  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2682  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.9 
 
 
328 aa  45.4  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4672  hypothetical protein  37.14 
 
 
214 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>