27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2682 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2682  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
328 aa  657    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0578  peptidoglycan-binding protein, putative  77.44 
 
 
338 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.641348  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0578  putative peptidoglycan-binding protein  77.44 
 
 
338 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0878  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.89 
 
 
266 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.605473  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0885  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.51 
 
 
307 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.36 
 
 
312 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1011  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.18 
 
 
317 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.404081  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0426  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.08 
 
 
281 aa  91.3  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.43216  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1306  hypothetical protein  27.9 
 
 
374 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3336  hypothetical protein  40.28 
 
 
266 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.986387  normal  0.0446379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2050  hypothetical protein  37.18 
 
 
269 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247709  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3760  hypothetical protein  37.18 
 
 
269 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.13 
 
 
305 aa  46.2  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3377  hypothetical protein  35.9 
 
 
269 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479611  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3636  hypothetical protein  35.9 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  25.58 
 
 
454 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1626  hypothetical protein  38.36 
 
 
269 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  29.41 
 
 
400 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  41.18 
 
 
407 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2632  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.37 
 
 
116 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2622  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.74 
 
 
201 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  30.43 
 
 
267 aa  43.5  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  26.52 
 
 
450 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3514  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.29 
 
 
267 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  40.28 
 
 
392 aa  42.7  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2885  spore cortex-lytic enzyme SleC  41.46 
 
 
438 aa  42.4  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.3 
 
 
327 aa  42.7  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>