19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3617 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1626  hypothetical protein  99.03 
 
 		 269 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3377  hypothetical protein  99.03 
 
 		 269 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3617  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  213  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3636  hypothetical protein  98.06 
 
 		 269 aa  213  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2050  hypothetical protein  96.12 
 
 		 269 aa  208  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247709  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3760  hypothetical protein  95.15 
 
 		 269 aa  207  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3336  hypothetical protein  90.29 
 
 		 266 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.986387  normal  0.0446379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1765  hypothetical protein  80.58 
 
 		 266 aa  181  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0173701  normal  0.140706 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1996  hypothetical protein  53.4 
 
 		 197 aa  121  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.242655 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1762  hypothetical protein  53.92 
 
 		 270 aa  119  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2991  hypothetical protein  54.46 
 
 		 271 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.570088  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  61.9 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  43.33 
 
 		 179 aa  50.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5526  hypothetical protein  53.85 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000157095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0268  hypothetical protein  51.35 
 
 		 301 aa  47.4  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0217918  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  37.18 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2669  hypothetical protein  37.88 
 
 		 283 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.526313  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  34.41 
 
 		 257 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  32.26 
 
 		 256 aa  40.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>