43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1183 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  348  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3317  hypothetical protein  48.68 
 
 		 254 aa  145  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  44.74 
 
 		 257 aa  140  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  48.03 
 
 		 256 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  30.06 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  28.22 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0128  hypothetical protein  33.03 
 
 		 435 aa  60.8  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3377  hypothetical protein  28.16 
 
 		 269 aa  58.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3760  hypothetical protein  28.16 
 
 		 269 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2050  hypothetical protein  28.65 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247709  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1996  hypothetical protein  31.62 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.242655 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32550  hypothetical protein  42.03 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.782691 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3336  hypothetical protein  26.44 
 
 		 266 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.986387  normal  0.0446379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1626  hypothetical protein  26.44 
 
 		 269 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2991  hypothetical protein  23.02 
 
 		 271 aa  52.4  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.570088  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3636  hypothetical protein  26.32 
 
 		 269 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5526  hypothetical protein  27.48 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000157095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4672  hypothetical protein  26.09 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  34.18 
 
 		 666 aa  48.1  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0189  hypothetical protein  26.62 
 
 		 242 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2687  hypothetical protein  34.83 
 
 		 267 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2731  hypothetical protein  34.83 
 
 		 267 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.342321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2717  hypothetical protein  34.83 
 
 		 267 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122181  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2886  hypothetical protein  31.03 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0811534  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1882  Lytic transglycosylase catalytic  35.53 
 
 		 715 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0113  hypothetical protein  29.07 
 
 		 252 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1765  hypothetical protein  25.55 
 
 		 266 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0173701  normal  0.140706 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1440  hypothetical protein  30.86 
 
 		 280 aa  45.4  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.159115  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3617  hypothetical protein  37.18 
 
 		 103 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0828  hypothetical protein  24.26 
 
 		 292 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2696  hypothetical protein  21.86 
 
 		 208 aa  45.1  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  20.42 
 
 		 324 aa  44.7  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1633  hypothetical protein  32.97 
 
 		 300 aa  44.7  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.631294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  32.91 
 
 		 671 aa  43.9  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2328  hypothetical protein  35.62 
 
 		 277 aa  43.9  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  33.77 
 
 		 657 aa  43.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2612  hypothetical protein  36.26 
 
 		 390 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2457  hypothetical protein  36 
 
 		 315 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148362  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1811  hypothetical protein  28.3 
 
 		 263 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  30.38 
 
 		 646 aa  41.6  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4178  hypothetical protein  42.62 
 
 		 358 aa  41.6  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0714985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05800  hypothetical protein  25.53 
 
 		 299 aa  41.2  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5524  putative cytoplasmic protein  27.54 
 
 		 196 aa  41.2  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.564525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>