23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1765 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1765  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0173701  normal  0.140706 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3336  hypothetical protein  81.95 
 
 		 266 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.986387  normal  0.0446379 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3760  hypothetical protein  75.19 
 
 		 269 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3377  hypothetical protein  75.57 
 
 		 269 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1626  hypothetical protein  75.19 
 
 		 269 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2050  hypothetical protein  75.57 
 
 		 269 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247709  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3636  hypothetical protein  74.43 
 
 		 269 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1762  hypothetical protein  41.39 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3617  hypothetical protein  80.58 
 
 		 103 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2991  hypothetical protein  38.66 
 
 		 271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.570088  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1996  hypothetical protein  40.87 
 
 		 197 aa  160  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.242655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  38.46 
 
 		 168 aa  89.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  37.28 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3064  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  32.48 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3317  hypothetical protein  31.58 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  32.89 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5526  hypothetical protein  35.96 
 
 		 148 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000157095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1633  hypothetical protein  29.52 
 
 		 300 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.631294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0128  hypothetical protein  28.49 
 
 		 435 aa  46.2  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  37.33 
 
 		 666 aa  45.8  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  25.55 
 
 		 166 aa  45.8  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2250  Lytic transglycosylase catalytic  35.62 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>