30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1633 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1633  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  615  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.631294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  37.5 
 
 		 671 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  37.78 
 
 		 646 aa  57  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  37.5 
 
 		 657 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  33.67 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3642  hypothetical protein  34.78 
 
 		 597 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1440  hypothetical protein  25.51 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.159115  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2696  hypothetical protein  32.91 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2886  hypothetical protein  25.79 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0811534  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  32.58 
 
 		 168 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05800  hypothetical protein  29.55 
 
 		 299 aa  49.7  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1043  hypothetical protein  37.97 
 
 		 364 aa  49.3  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0128  hypothetical protein  32.52 
 
 		 435 aa  49.3  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  28.22 
 
 		 666 aa  48.9  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  33.06 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2415  hypothetical protein  30.82 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1984  hypothetical protein  35.56 
 
 		 333 aa  47  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00235757  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1882  Lytic transglycosylase catalytic  30.77 
 
 		 715 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0268  hypothetical protein  32 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0217918  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1765  hypothetical protein  29.52 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0173701  normal  0.140706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0638  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  28.66 
 
 		 687 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1400  hypothetical protein  29.11 
 
 		 351 aa  45.8  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  32.97 
 
 		 166 aa  44.3  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  27.23 
 
 		 179 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  33.71 
 
 		 256 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2687  hypothetical protein  38.96 
 
 		 267 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4672  hypothetical protein  38.46 
 
 		 214 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2731  hypothetical protein  38.96 
 
 		 267 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.342321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2717  hypothetical protein  38.96 
 
 		 267 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122181  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3760  hypothetical protein  27.93 
 
 		 269 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>