32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2886 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2886  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  508  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0811534  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  49.32 
 
 
646 aa  203  2e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  46.22 
 
 
666 aa  202  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  41.32 
 
 
657 aa  190  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  44.1 
 
 
671 aa  190  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1811  hypothetical protein  38.86 
 
 
263 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1440  hypothetical protein  31.13 
 
 
280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.159115  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1400  hypothetical protein  34.59 
 
 
351 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2612  hypothetical protein  32.2 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1043  hypothetical protein  33.74 
 
 
364 aa  82.4  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0128  hypothetical protein  36.25 
 
 
435 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  31.46 
 
 
168 aa  55.8  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  24.53 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3642  hypothetical protein  33.33 
 
 
597 aa  52.4  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2781  hypothetical protein  30.41 
 
 
246 aa  52.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.302507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1633  hypothetical protein  25.79 
 
 
300 aa  52  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.631294  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  30.34 
 
 
179 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.47 
 
 
667 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0828  hypothetical protein  30.23 
 
 
292 aa  49.3  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  35.16 
 
 
324 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05800  hypothetical protein  29.47 
 
 
299 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1198  hypothetical protein  31.18 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5524  putative cytoplasmic protein  36.78 
 
 
196 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  31.03 
 
 
166 aa  47  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  26.23 
 
 
503 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1882  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 
715 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  27.27 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2317  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  30.59 
 
 
672 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5138  hypothetical protein  30.43 
 
 
231 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  26.23 
 
 
503 aa  42.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0638  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  34.62 
 
 
687 aa  42.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6086  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.8 
 
 
260 aa  42  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>