77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0572 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  100 
 
 		 646 aa  1314    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  51.06 
 
 		 657 aa  625  1e-178  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  48.82 
 
 		 671 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  37.61 
 
 		 666 aa  440  9.999999999999999e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0940  NLP/P60  40.94 
 
 		 421 aa  316  9e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0970  putative lipoprotein  37.53 
 
 		 448 aa  276  6e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1169  putative lipoprotein  38.32 
 
 		 444 aa  277  6e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1024  putative lipoprotein  37.07 
 
 		 448 aa  273  9e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1095  NLP/P60  36.24 
 
 		 442 aa  263  6e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.18265  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2886  hypothetical protein  49.32 
 
 		 248 aa  203  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0811534  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1403  NLP/P60 protein  28.35 
 
 		 484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2724  NLP/P60 family lipoprotein  27.61 
 
 		 457 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0991  NLP/P60 protein  28.28 
 
 		 459 aa  194  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000170293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2861  NLP/P60 protein  29.55 
 
 		 459 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2088  NLP/P60 protein  26.3 
 
 		 464 aa  190  8e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.1938  normal  0.0662136 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2458  hypothetical protein  31.85 
 
 		 452 aa  189  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0157952  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1599  NLP/P60 protein  32.7 
 
 		 459 aa  182  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1397  NLP/P60 protein  28.4 
 
 		 461 aa  170  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1811  hypothetical protein  35.85 
 
 		 263 aa  163  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1274  NLP/P60 protein  29.59 
 
 		 531 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.222916 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0507  NLP/P60 protein  29.62 
 
 		 399 aa  155  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0102185  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3276  putative cell wall-associated hydrolase protein  28.61 
 
 		 519 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2095  putative cell wall-associated hydrolase  28.78 
 
 		 477 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000538465  hitchhiker  0.000775655 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2102  putative cell wall-associated hydrolase  28.82 
 
 		 477 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00192881  hitchhiker  5.08057e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2155  putative cell wall-associated hydrolase  28.82 
 
 		 478 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277397  hitchhiker  0.00000000000022034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1181  putative cell wall-associated hydrolase  28.82 
 
 		 477 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000015464  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1304  putative cell wall-associated hydrolase  28.82 
 
 		 477 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0258474  hitchhiker  0.00000040862 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1440  hypothetical protein  34.78 
 
 		 280 aa  134  6e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.159115  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1881  NlpC-P60 family protein  25.78 
 
 		 532 aa  124  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1400  hypothetical protein  32.96 
 
 		 351 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0626  NLP/P60 protein  27.96 
 
 		 427 aa  93.2  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0476  NLP/P60 protein  25.74 
 
 		 459 aa  90.5  8e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0340  NLP/P60 protein  24.4 
 
 		 479 aa  88.6  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4171  NLP/P60  23.56 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0079177  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04246  NlpC/P60 family protein  24.14 
 
 		 470 aa  79.7  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2612  hypothetical protein  37.5 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1043  hypothetical protein  28 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6627  NLP/P60 protein  22.67 
 
 		 1101 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.813247  hitchhiker  0.000190725 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1633  hypothetical protein  37.78 
 
 		 300 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.631294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.48 
 
 		 667 aa  55.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  33.64 
 
 		 170 aa  55.1  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05800  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  54.7  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0128  hypothetical protein  37.84 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2781  hypothetical protein  26.81 
 
 		 246 aa  51.6  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.302507  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  27.22 
 
 		 257 aa  51.2  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  36.19 
 
 		 391 aa  51.2  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  33.77 
 
 		 256 aa  50.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  34.02 
 
 		 324 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  29.75 
 
 		 295 aa  48.9  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  35.48 
 
 		 346 aa  47.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.31 
 
 		 261 aa  47.8  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.51 
 
 		 260 aa  47  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0871  NLP/P60 protein  39.08 
 
 		 175 aa  47  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0638  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  27.27 
 
 		 687 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  30 
 
 		 342 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  29.03 
 
 		 179 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  28.23 
 
 		 202 aa  47  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5119  NLP/P60 protein  28.7 
 
 		 387 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.553866  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  31.96 
 
 		 255 aa  46.2  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0828  hypothetical protein  26.2 
 
 		 292 aa  46.2  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  32.38 
 
 		 265 aa  45.8  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  31.18 
 
 		 342 aa  45.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  28.21 
 
 		 168 aa  45.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  21.01 
 
 		 385 aa  45.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  31.87 
 
 		 342 aa  45.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  28.35 
 
 		 246 aa  44.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  30.77 
 
 		 341 aa  44.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 341 aa  44.3  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2669  hypothetical protein  30.39 
 
 		 283 aa  44.7  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.526313  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  30.88 
 
 		 259 aa  44.3  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3491  hypothetical protein  27.19 
 
 		 282 aa  44.3  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.599157  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6086  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.96 
 
 		 260 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3135  hypothetical protein  27.19 
 
 		 282 aa  44.3  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.308611  normal  0.0523709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5526  hypothetical protein  32.89 
 
 		 148 aa  43.9  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000157095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3642  hypothetical protein  29.27 
 
 		 597 aa  43.9  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  29.29 
 
 		 365 aa  43.9  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  29.29 
 
 		 365 aa  43.9  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>