124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0945 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 260 aa  531  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  39.08 
 
 		 292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2457  hypothetical protein  50.6 
 
 		 315 aa  175  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148362  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2781  hypothetical protein  48.54 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.302507  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3135  hypothetical protein  46.51 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.308611  normal  0.0523709 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3491  hypothetical protein  46.51 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.599157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  50.67 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  52.11 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.56 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.56 
 
 		 1089 aa  61.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.07 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 974 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  44.78 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3152  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.24 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.396034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5126  peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.22 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.283972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  48.44 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.44 
 
 		 554 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.03 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.54 
 
 		 317 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3376  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.75 
 
 		 283 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.76 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  56.9 
 
 		 160 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  51.72 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  51.85 
 
 		 2277 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6086  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.04 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  43.55 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.93 
 
 		 322 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.67 
 
 		 667 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.23 
 
 		 77 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1882  Lytic transglycosylase catalytic  39.24 
 
 		 715 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  46.88 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  49.12 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  51.67 
 
 		 349 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.62 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  45.59 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  42.11 
 
 		 204 aa  53.5  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.46 
 
 		 306 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.03 
 
 		 143 aa  52.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  45.16 
 
 		 762 aa  53.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  43.06 
 
 		 242 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.27 
 
 		 391 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  53.45 
 
 		 276 aa  52.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  68.42 
 
 		 629 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  58.93 
 
 		 233 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4788  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.27 
 
 		 163 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.907058  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.16 
 
 		 447 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  54.24 
 
 		 323 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50.85 
 
 		 372 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  40.54 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  49.15 
 
 		 462 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.46 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2988  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.09 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.97 
 
 		 559 aa  50.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3696  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.51 
 
 		 165 aa  49.7  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.46 
 
 		 364 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.69 
 
 		 792 aa  50.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.53 
 
 		 422 aa  50.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  57.14 
 
 		 232 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.46 
 
 		 433 aa  49.7  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4755  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.55 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3834  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  55.36 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  50 
 
 		 229 aa  48.9  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.16 
 
 		 412 aa  48.9  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  50 
 
 		 254 aa  48.9  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.33 
 
 		 319 aa  48.5  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  56.6 
 
 		 201 aa  48.9  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.07 
 
 		 170 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  56.1 
 
 		 356 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.68 
 
 		 379 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  55.36 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.46 
 
 		 575 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  31.51 
 
 		 646 aa  47  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  52 
 
 		 356 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.27 
 
 		 224 aa  46.6  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.67 
 
 		 326 aa  46.6  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2508  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.28 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0275667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.86 
 
 		 323 aa  45.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1811  hypothetical protein  26.5 
 
 		 263 aa  45.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 		 182 aa  45.4  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  51.72 
 
 		 383 aa  45.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2317  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  32.53 
 
 		 672 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 246 aa  45.4  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  51.72 
 
 		 358 aa  45.4  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3185  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.4 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00515387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.16 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.28 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1692  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.53 
 
 		 664 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  48.21 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  36.25 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  41.94 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  39.47 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  59.46 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2880  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.98 
 
 		 137 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248233  normal  0.229872 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  48.08 
 
 		 423 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  40.3 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.16 
 
 		 549 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 313 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>