34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0507 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0507  NLP/P60 protein  100 
 
 
399 aa  810    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0102185  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  31.93 
 
 
666 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0991  NLP/P60 protein  33.79 
 
 
459 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000170293  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2088  NLP/P60 protein  39.22 
 
 
464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.1938  normal  0.0662136 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2861  NLP/P60 protein  34.07 
 
 
459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2724  NLP/P60 family lipoprotein  33.33 
 
 
457 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1403  NLP/P60 protein  34.81 
 
 
484 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1397  NLP/P60 protein  34.84 
 
 
461 aa  176  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  30.82 
 
 
657 aa  173  5e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1095  NLP/P60  31.29 
 
 
442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.18265  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  30.06 
 
 
671 aa  162  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2458  hypothetical protein  31.17 
 
 
452 aa  160  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0157952  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1599  NLP/P60 protein  32.52 
 
 
459 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  29.62 
 
 
646 aa  155  9e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0940  NLP/P60  28.17 
 
 
421 aa  154  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1169  putative lipoprotein  26.05 
 
 
444 aa  142  9e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0970  putative lipoprotein  26.05 
 
 
448 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1024  putative lipoprotein  26.05 
 
 
448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2102  putative cell wall-associated hydrolase  30.51 
 
 
477 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00192881  hitchhiker  5.08057e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2155  putative cell wall-associated hydrolase  29.49 
 
 
478 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277397  hitchhiker  0.00000000000022034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2095  putative cell wall-associated hydrolase  29.49 
 
 
477 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000538465  hitchhiker  0.000775655 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1181  putative cell wall-associated hydrolase  29.49 
 
 
477 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000015464  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1304  putative cell wall-associated hydrolase  29.79 
 
 
477 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0258474  hitchhiker  0.00000040862 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1881  NlpC-P60 family protein  26.94 
 
 
532 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3276  putative cell wall-associated hydrolase protein  28.65 
 
 
519 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1274  NLP/P60 protein  28.03 
 
 
531 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.222916 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0476  NLP/P60 protein  23.03 
 
 
459 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0626  NLP/P60 protein  27.76 
 
 
427 aa  94.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0340  NLP/P60 protein  29.03 
 
 
479 aa  93.6  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4171  NLP/P60  23.32 
 
 
470 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0079177  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04246  NlpC/P60 family protein  26.11 
 
 
470 aa  70.5  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6627  NLP/P60 protein  25.4 
 
 
1101 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.813247  hitchhiker  0.000190725 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  40.38 
 
 
202 aa  43.9  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  28.12 
 
 
391 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>