116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0476 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0476  NLP/P60 protein  100 
 
 		 459 aa  942    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0626  NLP/P60 protein  29.61 
 
 		 427 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04246  NlpC/P60 family protein  25.56 
 
 		 470 aa  160  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0340  NLP/P60 protein  25.06 
 
 		 479 aa  153  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4171  NLP/P60  23.81 
 
 		 470 aa  147  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0079177  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0991  NLP/P60 protein  28.18 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000170293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0507  NLP/P60 protein  23.03 
 
 		 399 aa  103  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0102185  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  26.49 
 
 		 666 aa  101  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  25 
 
 		 671 aa  94.7  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  25.74 
 
 		 646 aa  90.5  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2088  NLP/P60 protein  22.03 
 
 		 464 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.1938  normal  0.0662136 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0940  NLP/P60  28.57 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1274  NLP/P60 protein  24.42 
 
 		 531 aa  89  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.222916 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1403  NLP/P60 protein  22.75 
 
 		 484 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2861  NLP/P60 protein  24.29 
 
 		 459 aa  86.7  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1095  NLP/P60  24.83 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.18265  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1599  NLP/P60 protein  22.76 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3276  putative cell wall-associated hydrolase protein  24.04 
 
 		 519 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  25.08 
 
 		 657 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1024  putative lipoprotein  26.04 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0970  putative lipoprotein  27.22 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2724  NLP/P60 family lipoprotein  24.2 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1397  NLP/P60 protein  23.77 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1169  putative lipoprotein  26.28 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1881  NlpC-P60 family protein  22.48 
 
 		 532 aa  75.1  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2458  hypothetical protein  19.54 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0157952  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  26.17 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2095  putative cell wall-associated hydrolase  20.56 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000538465  hitchhiker  0.000775655 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2102  putative cell wall-associated hydrolase  21.51 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00192881  hitchhiker  5.08057e-17 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6627  NLP/P60 protein  20.73 
 
 		 1101 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.813247  hitchhiker  0.000190725 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1304  putative cell wall-associated hydrolase  21.74 
 
 		 477 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0258474  hitchhiker  0.00000040862 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2155  putative cell wall-associated hydrolase  20.14 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277397  hitchhiker  0.00000000000022034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1181  putative cell wall-associated hydrolase  20.73 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000015464  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  26.39 
 
 		 365 aa  53.9  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  26.39 
 
 		 365 aa  53.9  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  31.19 
 
 		 281 aa  53.1  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  32.63 
 
 		 283 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0712  cell wall-associated hydrolase  25.32 
 
 		 306 aa  53.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  31.07 
 
 		 524 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  32.63 
 
 		 294 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  33.7 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  36.9 
 
 		 286 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  36.9 
 
 		 286 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  33.71 
 
 		 281 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  34.26 
 
 		 202 aa  49.3  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  30 
 
 		 162 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  33.71 
 
 		 286 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  31.11 
 
 		 279 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0870  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 232 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  29.75 
 
 		 476 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  30.43 
 
 		 556 aa  47.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4584  NLP/P60 protein  30.53 
 
 		 276 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  32.26 
 
 		 294 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  27.17 
 
 		 341 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  24.55 
 
 		 342 aa  47.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  27.96 
 
 		 345 aa  47  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  24.58 
 
 		 278 aa  46.6  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  34.69 
 
 		 210 aa  46.6  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  29.67 
 
 		 535 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0105  NLP/P60  34.09 
 
 		 278 aa  46.2  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  24.7 
 
 		 253 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  26.26 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3233  NLP/P60 protein  30.63 
 
 		 279 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  28.45 
 
 		 224 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  32.81 
 
 		 169 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  27.08 
 
 		 331 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3396  NLP/P60  30.7 
 
 		 234 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  30.61 
 
 		 224 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2656  NLP/P60 protein  32.69 
 
 		 225 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.939952  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0871  NLP/P60 protein  35.14 
 
 		 175 aa  45.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2384  NLP/P60 protein  31.48 
 
 		 364 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473535  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  32.18 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1127  NLP/P60 protein  31.18 
 
 		 286 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111374 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  30.61 
 
 		 223 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  30.61 
 
 		 223 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  30.61 
 
 		 223 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  27.1 
 
 		 286 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  30.61 
 
 		 223 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  30.61 
 
 		 223 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  33.66 
 
 		 178 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3470  NLP/P60 protein  33.98 
 
 		 231 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0763319  normal  0.422144 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  30.61 
 
 		 234 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  30.61 
 
 		 234 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  26.71 
 
 		 170 aa  44.3  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  29.53 
 
 		 210 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  30.61 
 
 		 218 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  30.61 
 
 		 218 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  30.61 
 
 		 234 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  30.61 
 
 		 218 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  30.61 
 
 		 218 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  28.74 
 
 		 306 aa  43.9  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2154  NLP/P60 protein  31.63 
 
 		 294 aa  44.3  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  30.61 
 
 		 240 aa  43.9  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  32.65 
 
 		 333 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2633  NLP/P60 protein  33.98 
 
 		 231 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 263 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  31.46 
 
 		 280 aa  43.9  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  29.79 
 
 		 532 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  32.65 
 
 		 333 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>