44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2088 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2088  NLP/P60 protein  100 
 
 		 464 aa  939    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.1938  normal  0.0662136 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1403  NLP/P60 protein  57.76 
 
 		 484 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1599  NLP/P60 protein  44.42 
 
 		 459 aa  356  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2724  NLP/P60 family lipoprotein  44.42 
 
 		 457 aa  353  5e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2861  NLP/P60 protein  46.21 
 
 		 459 aa  346  6e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0991  NLP/P60 protein  40.41 
 
 		 459 aa  321  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000170293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1095  NLP/P60  30.07 
 
 		 442 aa  272  1e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.18265  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  31.46 
 
 		 666 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2458  hypothetical protein  36.43 
 
 		 452 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0157952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1397  NLP/P60 protein  34.73 
 
 		 461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1881  NlpC-P60 family protein  30.27 
 
 		 532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  27.76 
 
 		 657 aa  192  9e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0507  NLP/P60 protein  39.53 
 
 		 399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0102185  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  26.38 
 
 		 646 aa  190  5.999999999999999e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0940  NLP/P60  27.01 
 
 		 421 aa  187  4e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1181  putative cell wall-associated hydrolase  32.78 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000015464  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2095  putative cell wall-associated hydrolase  32.78 
 
 		 477 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000538465  hitchhiker  0.000775655 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2155  putative cell wall-associated hydrolase  31.7 
 
 		 478 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277397  hitchhiker  0.00000000000022034 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2102  putative cell wall-associated hydrolase  33.24 
 
 		 477 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00192881  hitchhiker  5.08057e-17 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  30.13 
 
 		 671 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1304  putative cell wall-associated hydrolase  32.5 
 
 		 477 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0258474  hitchhiker  0.00000040862 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1274  NLP/P60 protein  30.33 
 
 		 531 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.222916 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3276  putative cell wall-associated hydrolase protein  32.24 
 
 		 519 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0970  putative lipoprotein  23.57 
 
 		 448 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1024  putative lipoprotein  23.57 
 
 		 448 aa  161  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1169  putative lipoprotein  23.79 
 
 		 444 aa  161  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0626  NLP/P60 protein  25.96 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0340  NLP/P60 protein  27.15 
 
 		 479 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04246  NlpC/P60 family protein  27.68 
 
 		 470 aa  91.7  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0476  NLP/P60 protein  22.11 
 
 		 459 aa  90.9  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4171  NLP/P60  24.75 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0079177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6627  NLP/P60 protein  32.16 
 
 		 1101 aa  66.6  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.813247  hitchhiker  0.000190725 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0871  NLP/P60 protein  32.58 
 
 		 175 aa  51.2  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  28.93 
 
 		 256 aa  51.2  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  36.05 
 
 		 265 aa  50.1  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  23.95 
 
 		 333 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  32.95 
 
 		 257 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  25.77 
 
 		 266 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  29.63 
 
 		 271 aa  45.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  30 
 
 		 295 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  29.63 
 
 		 261 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  27.66 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  22.3 
 
 		 170 aa  44.3  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  36.26 
 
 		 189 aa  43.1  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>