35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6086 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6086  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 260 aa  532  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1882  Lytic transglycosylase catalytic  58.56 
 
 		 715 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2317  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  54.17 
 
 		 672 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1692  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  53.12 
 
 		 664 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0638  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  44.06 
 
 		 687 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1984  hypothetical protein  32.88 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00235757  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  36.28 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0128  hypothetical protein  34.56 
 
 		 435 aa  62.4  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3135  hypothetical protein  37.97 
 
 		 282 aa  62  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.308611  normal  0.0523709 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3491  hypothetical protein  37.97 
 
 		 282 aa  62  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.599157  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3317  hypothetical protein  35.65 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.04 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  33.91 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2457  hypothetical protein  34.94 
 
 		 315 aa  52  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148362  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1699  hypothetical protein  38.1 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  38.96 
 
 		 657 aa  46.2  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32550  hypothetical protein  36.71 
 
 		 218 aa  45.8  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.782691 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  35.96 
 
 		 671 aa  45.8  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.98 
 
 		 391 aa  45.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 321 aa  45.4  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1440  hypothetical protein  34.83 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.159115  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  29.2 
 
 		 666 aa  45.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2328  hypothetical protein  37.35 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2781  hypothetical protein  35.29 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.302507  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0101  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.1 
 
 		 294 aa  43.9  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  26.77 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5526  hypothetical protein  35.29 
 
 		 148 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000157095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2786  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.94 
 
 		 587 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  35.96 
 
 		 646 aa  44.3  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.68 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  31.25 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  33.82 
 
 		 423 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.71 
 
 		 554 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.71 
 
 		 300 aa  42.7  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  36.07 
 
 		 229 aa  42.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>