55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3276 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1274  NLP/P60 protein  87.91 
 
 		 531 aa  884    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.222916 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3276  putative cell wall-associated hydrolase protein  100 
 
 		 519 aa  1049    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1881  NlpC-P60 family protein  39.5 
 
 		 532 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2102  putative cell wall-associated hydrolase  40.2 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00192881  hitchhiker  5.08057e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1181  putative cell wall-associated hydrolase  40.75 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000015464  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2095  putative cell wall-associated hydrolase  41.58 
 
 		 477 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000538465  hitchhiker  0.000775655 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2155  putative cell wall-associated hydrolase  41.58 
 
 		 478 aa  362  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277397  hitchhiker  0.00000000000022034 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1304  putative cell wall-associated hydrolase  40.2 
 
 		 477 aa  359  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0258474  hitchhiker  0.00000040862 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2724  NLP/P60 family lipoprotein  31.03 
 
 		 457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1403  NLP/P60 protein  30.46 
 
 		 484 aa  182  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0991  NLP/P60 protein  30.87 
 
 		 459 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000170293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  30.81 
 
 		 657 aa  169  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2088  NLP/P60 protein  32.24 
 
 		 464 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.1938  normal  0.0662136 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  32.31 
 
 		 671 aa  159  9e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2861  NLP/P60 protein  31.51 
 
 		 459 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  28.99 
 
 		 666 aa  157  6e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  29.41 
 
 		 646 aa  155  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0940  NLP/P60  26.24 
 
 		 421 aa  147  6e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1599  NLP/P60 protein  27.08 
 
 		 459 aa  144  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1095  NLP/P60  24.86 
 
 		 442 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.18265  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1397  NLP/P60 protein  31.13 
 
 		 461 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2458  hypothetical protein  29.75 
 
 		 452 aa  137  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0157952  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1024  putative lipoprotein  24.8 
 
 		 448 aa  126  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0970  putative lipoprotein  24.26 
 
 		 448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1169  putative lipoprotein  24.53 
 
 		 444 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0507  NLP/P60 protein  28.11 
 
 		 399 aa  120  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0102185  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0476  NLP/P60 protein  24.04 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0626  NLP/P60 protein  22.74 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04246  NlpC/P60 family protein  28.9 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0340  NLP/P60 protein  27.72 
 
 		 479 aa  80.5  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4171  NLP/P60  24.86 
 
 		 470 aa  75.1  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0079177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6627  NLP/P60 protein  38.83 
 
 		 1101 aa  57  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.813247  hitchhiker  0.000190725 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  33.02 
 
 		 280 aa  51.2  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  33.05 
 
 		 216 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  27.16 
 
 		 335 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  34.09 
 
 		 349 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  32.67 
 
 		 170 aa  48.1  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  32.95 
 
 		 329 aa  47  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  31.87 
 
 		 333 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  31.16 
 
 		 256 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  31.16 
 
 		 256 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  34.88 
 
 		 1048 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  31.09 
 
 		 208 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  31.33 
 
 		 524 aa  44.3  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  29.17 
 
 		 417 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  29.57 
 
 		 257 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  30.45 
 
 		 257 aa  43.9  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  34.78 
 
 		 347 aa  43.9  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  30.45 
 
 		 257 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  30.45 
 
 		 257 aa  43.9  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  30.1 
 
 		 256 aa  43.9  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  29.46 
 
 		 295 aa  43.5  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  35.51 
 
 		 308 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 173 aa  43.5  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  26.36 
 
 		 391 aa  43.5  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>