26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0638 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0638  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  100 
 
 		 687 aa  1386    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1692  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.22 
 
 		 664 aa  352  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2317  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  35.92 
 
 		 672 aa  341  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6086  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.06 
 
 		 260 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1882  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 715 aa  150  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3633  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  35.23 
 
 		 641 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2175  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.88 
 
 		 624 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1445  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  35.48 
 
 		 644 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0212  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  25 
 
 		 418 aa  90.9  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.521983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.7 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  36.99 
 
 		 257 aa  67  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3317  hypothetical protein  34.27 
 
 		 254 aa  60.1  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0128  hypothetical protein  30.38 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  35.62 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1984  hypothetical protein  29.94 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00235757  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2282  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  27.76 
 
 		 641 aa  54.7  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.169822 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1440  hypothetical protein  32.26 
 
 		 280 aa  47.4  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.159115  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  22.54 
 
 		 666 aa  47.4  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3135  hypothetical protein  32.05 
 
 		 282 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.308611  normal  0.0523709 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  27.27 
 
 		 646 aa  47  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4178  hypothetical protein  41.25 
 
 		 358 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0714985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2928  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  31.82 
 
 		 426 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2630  hypothetical protein  44.26 
 
 		 266 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1633  hypothetical protein  28.66 
 
 		 300 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.631294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3491  hypothetical protein  32.05 
 
 		 282 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.599157  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5526  hypothetical protein  33.7 
 
 		 148 aa  44.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000157095  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>