50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2367 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  528  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3317  hypothetical protein  93.36 
 
 		 254 aa  461  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  72.09 
 
 		 257 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  48.03 
 
 		 166 aa  145  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  34.73 
 
 		 168 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  33.94 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1882  Lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 		 715 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3336  hypothetical protein  32.03 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.986387  normal  0.0446379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2050  hypothetical protein  30.72 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247709  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1765  hypothetical protein  32.68 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0173701  normal  0.140706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0128  hypothetical protein  44.9 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0638  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  36.3 
 
 		 687 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3377  hypothetical protein  30.72 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1762  hypothetical protein  30.37 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3636  hypothetical protein  30.07 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1626  hypothetical protein  29.41 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3760  hypothetical protein  29.41 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6086  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.91 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2991  hypothetical protein  29.93 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.570088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32550  hypothetical protein  39.81 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.782691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4178  hypothetical protein  41.49 
 
 		 358 aa  52.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0714985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  30.26 
 
 		 666 aa  52.4  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2328  hypothetical protein  40.24 
 
 		 277 aa  52  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4672  hypothetical protein  28.57 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2696  hypothetical protein  27.38 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  26.92 
 
 		 646 aa  51.6  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1996  hypothetical protein  28.26 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.242655 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.7 
 
 		 667 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2415  hypothetical protein  25.99 
 
 		 358 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2886  hypothetical protein  23.27 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0811534  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  27.78 
 
 		 657 aa  48.5  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  29.82 
 
 		 671 aa  48.5  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5526  hypothetical protein  39.47 
 
 		 148 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000157095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2717  hypothetical protein  35.56 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122181  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2687  hypothetical protein  35.56 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2731  hypothetical protein  35.56 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.342321 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0828  hypothetical protein  26.9 
 
 		 292 aa  45.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1633  hypothetical protein  32.26 
 
 		 300 aa  45.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.631294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3642  hypothetical protein  36.76 
 
 		 597 aa  45.8  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2457  hypothetical protein  35.9 
 
 		 315 aa  45.8  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148362  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1400  hypothetical protein  30.92 
 
 		 351 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1692  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.25 
 
 		 664 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.67 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1699  hypothetical protein  37.93 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0189  hypothetical protein  31.78 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0113  hypothetical protein  41.79 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3491  hypothetical protein  44 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.599157  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3135  hypothetical protein  44 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.308611  normal  0.0523709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2317  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  32.79 
 
 		 672 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1198  hypothetical protein  32.61 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>