13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2328 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2328  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  562  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32550  hypothetical protein  57.24 
 
 
218 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.782691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4178  hypothetical protein  49.02 
 
 
358 aa  102  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0714985  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0651  hypothetical protein  37.5 
 
 
227 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2453  hypothetical protein  38.2 
 
 
215 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.291463  hitchhiker  0.000000279233 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  37.04 
 
 
257 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3317  hypothetical protein  35.71 
 
 
254 aa  53.1  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  40.24 
 
 
256 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19420  hypothetical protein  31.37 
 
 
194 aa  49.3  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.643676  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1882  Lytic transglycosylase catalytic  41.33 
 
 
715 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6086  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.35 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  35.62 
 
 
166 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2649  CHAP domain containing protein  30.37 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.112963 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>