19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32550 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_32550  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  443  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.782691 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2328  hypothetical protein  57.24 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4178  hypothetical protein  53 
 
 		 358 aa  105  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0714985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0651  hypothetical protein  40.15 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19420  hypothetical protein  34.93 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.643676  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2453  hypothetical protein  44.32 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.291463  hitchhiker  0.000000279233 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  42.03 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3317  hypothetical protein  36.51 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  45.26 
 
 		 257 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  39.81 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0128  hypothetical protein  44.29 
 
 		 435 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1882  Lytic transglycosylase catalytic  40.51 
 
 		 715 aa  48.9  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6086  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.71 
 
 		 260 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1699  hypothetical protein  27.08 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  28 
 
 		 324 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2717  hypothetical protein  40 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122181  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05800  hypothetical protein  26.03 
 
 		 299 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2731  hypothetical protein  40 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.342321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2687  hypothetical protein  40 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>