33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2415 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2415  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  716    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0189  hypothetical protein  54.03 
 
 
242 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4672  hypothetical protein  56.7 
 
 
214 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0828  hypothetical protein  55.22 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0134  hypothetical protein  50.47 
 
 
247 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1198  hypothetical protein  46.05 
 
 
242 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  45.45 
 
 
503 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5138  hypothetical protein  52.66 
 
 
231 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0113  hypothetical protein  49.12 
 
 
252 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  45.27 
 
 
503 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2717  hypothetical protein  50.89 
 
 
267 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122181  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2731  hypothetical protein  50.89 
 
 
267 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.342321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2687  hypothetical protein  50.89 
 
 
267 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05800  hypothetical protein  37.01 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  45.88 
 
 
324 aa  170  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5524  putative cytoplasmic protein  50.86 
 
 
196 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2696  hypothetical protein  44.71 
 
 
208 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0464  hypothetical protein  45.61 
 
 
286 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000209316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0695  hypothetical protein  45.61 
 
 
286 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0888  hypothetical protein  45.61 
 
 
286 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0430779  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1413  hypothetical protein  45.61 
 
 
286 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.430861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1650  hypothetical protein  45.03 
 
 
286 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1629  hypothetical protein  45.03 
 
 
286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0613071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1806  hypothetical protein  45.03 
 
 
283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2669  hypothetical protein  41.71 
 
 
283 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.526313  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0268  hypothetical protein  36 
 
 
301 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0217918  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1282  Ig domain-containing protein  41.62 
 
 
465 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.592505  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.51 
 
 
667 aa  60.1  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3317  hypothetical protein  25 
 
 
254 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  26.92 
 
 
257 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  31.25 
 
 
256 aa  47  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1633  hypothetical protein  30.82 
 
 
300 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.631294  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  44.44 
 
 
1281 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>