27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1282 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1282  Ig domain-containing protein  100 
 
 
465 aa  921    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.592505  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2415  hypothetical protein  50.4 
 
 
358 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0828  hypothetical protein  38.02 
 
 
292 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4672  hypothetical protein  44.78 
 
 
214 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0189  hypothetical protein  38.1 
 
 
242 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05800  hypothetical protein  34.76 
 
 
299 aa  101  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  36.9 
 
 
503 aa  99.8  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0134  hypothetical protein  38.28 
 
 
247 aa  95.5  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1198  hypothetical protein  35.2 
 
 
242 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  34.91 
 
 
503 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5524  putative cytoplasmic protein  36.05 
 
 
196 aa  90.5  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0113  hypothetical protein  38.41 
 
 
252 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5138  hypothetical protein  40.83 
 
 
231 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  29.19 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2717  hypothetical protein  37.01 
 
 
267 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122181  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2731  hypothetical protein  37.01 
 
 
267 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.342321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2687  hypothetical protein  37.01 
 
 
267 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2696  hypothetical protein  26.56 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0268  hypothetical protein  28.98 
 
 
301 aa  72.8  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0217918  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0888  hypothetical protein  36.84 
 
 
286 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0430779  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0695  hypothetical protein  36.84 
 
 
286 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1650  hypothetical protein  36.84 
 
 
286 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0464  hypothetical protein  36.84 
 
 
286 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000209316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1413  hypothetical protein  36.84 
 
 
286 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.430861  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1806  hypothetical protein  36.84 
 
 
283 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1629  hypothetical protein  36.84 
 
 
286 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0613071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2669  hypothetical protein  32.49 
 
 
283 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.526313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>