36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0134 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0134  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  511  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0189  hypothetical protein  57.43 
 
 
242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0113  hypothetical protein  53.94 
 
 
252 aa  225  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2415  hypothetical protein  51.87 
 
 
358 aa  203  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4672  hypothetical protein  49.24 
 
 
214 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1198  hypothetical protein  43.28 
 
 
242 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5138  hypothetical protein  51.11 
 
 
231 aa  191  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2687  hypothetical protein  49.17 
 
 
267 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2731  hypothetical protein  49.17 
 
 
267 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.342321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2717  hypothetical protein  49.17 
 
 
267 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122181  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0828  hypothetical protein  47.37 
 
 
292 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  44.97 
 
 
324 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5524  putative cytoplasmic protein  46.24 
 
 
196 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05800  hypothetical protein  46.43 
 
 
299 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2696  hypothetical protein  38.12 
 
 
208 aa  138  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  37 
 
 
503 aa  135  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  37.5 
 
 
503 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1413  hypothetical protein  37.11 
 
 
286 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.430861  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0695  hypothetical protein  37.11 
 
 
286 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0888  hypothetical protein  37.11 
 
 
286 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0430779  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0464  hypothetical protein  37.11 
 
 
286 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000209316  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1629  hypothetical protein  37.11 
 
 
286 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0613071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1650  hypothetical protein  37.11 
 
 
286 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1806  hypothetical protein  37.11 
 
 
283 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2669  hypothetical protein  35.35 
 
 
283 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.526313  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0268  hypothetical protein  33.92 
 
 
301 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0217918  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1282  Ig domain-containing protein  34.97 
 
 
465 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.592505  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.34 
 
 
667 aa  59.7  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  29.45 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  29.29 
 
 
166 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1633  hypothetical protein  35.53 
 
 
300 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.631294  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  32.71 
 
 
168 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  32.11 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1046  hypothetical protein  43.24 
 
 
407 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2857  hypothetical protein  38.64 
 
 
525 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3317  hypothetical protein  28.95 
 
 
254 aa  42.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>