30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1650 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1650  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0888  hypothetical protein  99.3 
 
 
286 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0430779  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0695  hypothetical protein  99.3 
 
 
286 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1413  hypothetical protein  99.3 
 
 
286 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.430861  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0464  hypothetical protein  99.3 
 
 
286 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000209316  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1629  hypothetical protein  98.95 
 
 
286 aa  583  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0613071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1806  hypothetical protein  99.29 
 
 
283 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2669  hypothetical protein  85.87 
 
 
283 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.526313  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0268  hypothetical protein  44.59 
 
 
301 aa  223  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0217918  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0828  hypothetical protein  46.2 
 
 
292 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4672  hypothetical protein  46.2 
 
 
214 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5138  hypothetical protein  42.13 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2415  hypothetical protein  45.03 
 
 
358 aa  132  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1198  hypothetical protein  40.4 
 
 
242 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0189  hypothetical protein  44.19 
 
 
242 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2717  hypothetical protein  42.44 
 
 
267 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122181  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2731  hypothetical protein  42.44 
 
 
267 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.342321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2687  hypothetical protein  42.44 
 
 
267 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05800  hypothetical protein  43.29 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0113  hypothetical protein  50.48 
 
 
252 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2696  hypothetical protein  37.63 
 
 
208 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5524  putative cytoplasmic protein  40 
 
 
196 aa  115  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0134  hypothetical protein  40.77 
 
 
247 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  34.31 
 
 
324 aa  112  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  34.16 
 
 
503 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  32.67 
 
 
503 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1282  Ig domain-containing protein  36.84 
 
 
465 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.592505  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2991  hypothetical protein  41.51 
 
 
271 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.570088  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  26.47 
 
 
646 aa  43.1  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1400  hypothetical protein  31.86 
 
 
351 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>