40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0268 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0268  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  633    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0217918  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0695  hypothetical protein  44.16 
 
 		 286 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0464  hypothetical protein  44.16 
 
 		 286 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000209316  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0888  hypothetical protein  44.16 
 
 		 286 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0430779  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1413  hypothetical protein  44.16 
 
 		 286 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.430861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1650  hypothetical protein  44.59 
 
 		 286 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1629  hypothetical protein  44.59 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0613071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1806  hypothetical protein  43.72 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2669  hypothetical protein  44.54 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.526313  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0828  hypothetical protein  38.42 
 
 		 292 aa  133  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4672  hypothetical protein  39.64 
 
 		 214 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  39.33 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05800  hypothetical protein  41.1 
 
 		 299 aa  129  9.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1198  hypothetical protein  38.73 
 
 		 242 aa  125  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2731  hypothetical protein  38.15 
 
 		 267 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.342321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2687  hypothetical protein  38.15 
 
 		 267 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2717  hypothetical protein  38.15 
 
 		 267 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122181  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2415  hypothetical protein  36 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5138  hypothetical protein  37.57 
 
 		 231 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2696  hypothetical protein  32.87 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0189  hypothetical protein  38.01 
 
 		 242 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0113  hypothetical protein  46.3 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5524  putative cytoplasmic protein  35.76 
 
 		 196 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0134  hypothetical protein  41.9 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  28 
 
 		 503 aa  93.6  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  28.69 
 
 		 503 aa  92  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1282  Ig domain-containing protein  28.98 
 
 		 465 aa  72.8  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.592505  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2050  hypothetical protein  35.8 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247709  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3760  hypothetical protein  51.35 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3377  hypothetical protein  51.35 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3636  hypothetical protein  51.35 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3617  hypothetical protein  51.35 
 
 		 103 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1626  hypothetical protein  51.35 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1633  hypothetical protein  32 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.631294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1440  hypothetical protein  30.11 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.159115  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1400  hypothetical protein  29.9 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  43.48 
 
 		 168 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  27 
 
 		 646 aa  43.1  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  41.3 
 
 		 179 aa  43.1  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  28 
 
 		 671 aa  42.4  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>