23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3377 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3377  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3760  hypothetical protein  95.91 
 
 		 269 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2050  hypothetical protein  95.54 
 
 		 269 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247709  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1626  hypothetical protein  94.42 
 
 		 269 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3636  hypothetical protein  93.68 
 
 		 269 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3336  hypothetical protein  81.58 
 
 		 266 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.986387  normal  0.0446379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1765  hypothetical protein  75.57 
 
 		 266 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0173701  normal  0.140706 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3617  hypothetical protein  99.03 
 
 		 103 aa  214  9e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1762  hypothetical protein  40.29 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2991  hypothetical protein  38.72 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.570088  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1996  hypothetical protein  43.65 
 
 		 197 aa  168  8e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.242655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  42.74 
 
 		 168 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  38.37 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  31.85 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  30.92 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3317  hypothetical protein  29.41 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  28.47 
 
 		 166 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5526  hypothetical protein  44.26 
 
 		 148 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000157095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3064  hypothetical protein  88.89 
 
 		 81 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0268  hypothetical protein  51.35 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0217918  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2682  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.9 
 
 		 328 aa  45.8  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  25.71 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3803  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 		 328 aa  42.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633002  normal  0.020318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>