23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3760 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3760  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3377  hypothetical protein  95.91 
 
 		 269 aa  513  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2050  hypothetical protein  94.8 
 
 		 269 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247709  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3636  hypothetical protein  93.68 
 
 		 269 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1626  hypothetical protein  93.31 
 
 		 269 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3336  hypothetical protein  81.95 
 
 		 266 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.986387  normal  0.0446379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1765  hypothetical protein  75.19 
 
 		 266 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0173701  normal  0.140706 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3617  hypothetical protein  95.15 
 
 		 103 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1762  hypothetical protein  39.37 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2991  hypothetical protein  37.97 
 
 		 271 aa  171  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.570088  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1996  hypothetical protein  43.15 
 
 		 197 aa  166  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.242655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  37.21 
 
 		 168 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  36.63 
 
 		 179 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  31.21 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  29.61 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  28.47 
 
 		 166 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3317  hypothetical protein  28.1 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5526  hypothetical protein  44.26 
 
 		 148 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000157095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3064  hypothetical protein  88.89 
 
 		 81 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0268  hypothetical protein  51.35 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0217918  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2682  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.18 
 
 		 328 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  25.71 
 
 		 324 aa  43.5  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1633  hypothetical protein  27.93 
 
 		 300 aa  42.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.631294  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>