39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3058 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  100 
 
 		 179 aa  370  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  88.1 
 
 		 168 aa  315  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1765  hypothetical protein  37.28 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0173701  normal  0.140706 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3377  hypothetical protein  38.37 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3760  hypothetical protein  36.63 
 
 		 269 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2050  hypothetical protein  40.32 
 
 		 269 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247709  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1626  hypothetical protein  37.79 
 
 		 269 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3636  hypothetical protein  38.37 
 
 		 269 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3317  hypothetical protein  33.94 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  34.55 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3336  hypothetical protein  35.47 
 
 		 266 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.986387  normal  0.0446379 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1762  hypothetical protein  32.35 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  28.22 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1996  hypothetical protein  30.81 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.242655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2991  hypothetical protein  31.98 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.570088  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  29.91 
 
 		 671 aa  52.4  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  35.14 
 
 		 657 aa  52  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2886  hypothetical protein  30.34 
 
 		 248 aa  51.2  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0811534  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5526  hypothetical protein  37.68 
 
 		 148 aa  50.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000157095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2612  hypothetical protein  30.16 
 
 		 390 aa  50.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3617  hypothetical protein  43.33 
 
 		 103 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1400  hypothetical protein  30.58 
 
 		 351 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2696  hypothetical protein  23.95 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1440  hypothetical protein  35.9 
 
 		 280 aa  48.5  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.159115  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1699  hypothetical protein  32.8 
 
 		 243 aa  47.8  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  29.03 
 
 		 646 aa  46.6  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  31.65 
 
 		 666 aa  45.8  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  26.88 
 
 		 324 aa  44.3  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.52 
 
 		 667 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3642  hypothetical protein  35.14 
 
 		 597 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4672  hypothetical protein  34.09 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1043  hypothetical protein  28 
 
 		 364 aa  43.9  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0268  hypothetical protein  41.3 
 
 		 301 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0217918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1633  hypothetical protein  27.23 
 
 		 300 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.631294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0189  hypothetical protein  32.73 
 
 		 242 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5524  putative cytoplasmic protein  28.85 
 
 		 196 aa  41.2  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2457  hypothetical protein  33.65 
 
 		 315 aa  40.8  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148362  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1811  hypothetical protein  30.86 
 
 		 263 aa  40.8  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>