23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3642 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3642  hypothetical protein  100 
 
 		 597 aa  1214    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4158  hypothetical protein  30.06 
 
 		 566 aa  139  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0809  lytic transglycosylase, catalytic  29.61 
 
 		 669 aa  136  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1985  hypothetical protein  31.25 
 
 		 711 aa  134  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1168  lytic transglycosylase, catalytic  29.28 
 
 		 669 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129127 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2251  putative bacteriophage protein  35.34 
 
 		 632 aa  125  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2403  hypothetical protein  27.06 
 
 		 564 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1814  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  26.32 
 
 		 677 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3084  Lytic transglycosylase catalytic  29.75 
 
 		 623 aa  99  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1699  hypothetical protein  35.14 
 
 		 243 aa  76.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4178  hypothetical protein  36.84 
 
 		 358 aa  54.3  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0714985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1633  hypothetical protein  34.78 
 
 		 300 aa  53.9  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.631294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2886  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0811534  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0128  hypothetical protein  34.78 
 
 		 435 aa  51.2  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  39.19 
 
 		 168 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  47.4  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  31.82 
 
 		 324 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  36.76 
 
 		 256 aa  45.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2493  hypothetical protein  28.83 
 
 		 216 aa  44.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2055  hypothetical protein  29.73 
 
 		 216 aa  44.3  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  29.27 
 
 		 646 aa  43.9  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3317  hypothetical protein  35.29 
 
 		 254 aa  43.9  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  35.14 
 
 		 179 aa  43.9  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>