18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4158 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4158  hypothetical protein  100 
 
 
566 aa  1135    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0809  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 
669 aa  160  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2251  putative bacteriophage protein  38.57 
 
 
632 aa  153  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1168  lytic transglycosylase, catalytic  31.75 
 
 
669 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3642  hypothetical protein  30.06 
 
 
597 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2403  hypothetical protein  29.06 
 
 
564 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1814  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  28.98 
 
 
677 aa  124  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1985  hypothetical protein  30.59 
 
 
711 aa  106  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3084  Lytic transglycosylase catalytic  28.86 
 
 
623 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3643  hypothetical protein  25.32 
 
 
642 aa  94.7  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  37.96 
 
 
968 aa  62.4  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0566  hypothetical protein  36.23 
 
 
252 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1293  hypothetical protein  20.59 
 
 
629 aa  55.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1025  hypothetical protein  20.08 
 
 
629 aa  53.5  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1262  hypothetical protein  20.08 
 
 
629 aa  53.5  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3521  putative transmembrane protein  34.59 
 
 
230 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4117  putative transmembrane protein  33.09 
 
 
200 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0443  hypothetical protein  37.18 
 
 
945 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.616672  normal  0.0723383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>