19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4117 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4117  putative transmembrane protein  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3521  putative transmembrane protein  55.74 
 
 		 230 aa  208  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0566  hypothetical protein  52.97 
 
 		 252 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1636  putative transmembrane protein  49.01 
 
 		 271 aa  181  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1808  putative transmembrane protein  46.45 
 
 		 269 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.849383  hitchhiker  0.00211486 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0474  hypothetical protein  28.05 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.359279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1814  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  35.86 
 
 		 677 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0595  hypothetical protein  29.63 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15601  endolysin  38.18 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.719479 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  39.22 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  39.81 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1453  muramidase  37 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0618214 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  34.95 
 
 		 968 aa  55.8  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1047  muramidase  39.22 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0905977  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4158  hypothetical protein  33.09 
 
 		 566 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4138  hypothetical protein  35 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000136425  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3902  hypothetical protein  35 
 
 		 339 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0303474  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18641  endolysin  37.93 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1848  putative bacteriophage endolysin protein  35.96 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>