29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1453 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1453  muramidase  100 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0618214 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1047  muramidase  79.73 
 
 		 224 aa  359  2e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0905977  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15601  endolysin  69.8 
 
 		 266 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.719479 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  59.74 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  56.88 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18641  endolysin  54.39 
 
 		 194 aa  184  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  35.06 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2276  lysozyme  31.25 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00766878  hitchhiker  1.42848e-18 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2206  lysozyme  31.03 
 
 		 630 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1613  lysozyme  32.35 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.875614  hitchhiker  0.00136066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  31.94 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1700  bacteriophage endolysin protein  35.66 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00728  hypothetical protein  31.62 
 
 		 158 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00935767  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10030  cell lysis protein  31.62 
 
 		 158 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.011177  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1848  putative bacteriophage endolysin protein  36.96 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0209  hypothetical protein  30.92 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0202291  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2511  Lysozyme  30.97 
 
 		 162 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4117  putative transmembrane protein  37 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  34.96 
 
 		 161 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1852  glycoside hydrolase family protein  33.1 
 
 		 150 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0259266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3944  muramidase (phage lambda lysozyme)-like  28.68 
 
 		 347 aa  51.6  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0252  lysozyme  30.12 
 
 		 96 aa  49.3  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3521  putative transmembrane protein  29.41 
 
 		 230 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1636  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 271 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1526  Lysozyme  28.22 
 
 		 163 aa  46.2  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1808  putative transmembrane protein  31.88 
 
 		 269 aa  45.4  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.849383  hitchhiker  0.00211486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0566  hypothetical protein  33.01 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2416  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 173 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2111  Lysozyme  28.21 
 
 		 163 aa  42.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>