37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0896 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  100 
 
 		 161 aa  319  8e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2511  Lysozyme  58.94 
 
 		 162 aa  177  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1700  bacteriophage endolysin protein  56.33 
 
 		 163 aa  168  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  56.49 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  55.1 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00728  hypothetical protein  54.42 
 
 		 158 aa  153  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00935767  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10030  cell lysis protein  54.42 
 
 		 158 aa  153  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.011177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4330  phage lysozyme  53.16 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664244 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1613  lysozyme  55.1 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.875614  hitchhiker  0.00136066 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2276  lysozyme  54.11 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00766878  hitchhiker  1.42848e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3045  phage lysozyme  53.21 
 
 		 165 aa  151  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011142 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2416  glycoside hydrolase family protein  49.7 
 
 		 173 aa  141  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2111  Lysozyme  47.13 
 
 		 163 aa  132  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1526  Lysozyme  48.41 
 
 		 163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1852  glycoside hydrolase family protein  48.68 
 
 		 150 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0259266  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1848  putative bacteriophage endolysin protein  45.12 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2206  lysozyme  41.55 
 
 		 630 aa  104  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0252  lysozyme  58.82 
 
 		 96 aa  97.8  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0209  hypothetical protein  36.81 
 
 		 274 aa  87.8  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0202291  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3944  muramidase (phage lambda lysozyme)-like  36.23 
 
 		 347 aa  79  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18641  endolysin  38.41 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00141  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  71.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.194943  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  37.5 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  36.81 
 
 		 207 aa  67.4  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1047  muramidase  33.78 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0905977  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15601  endolysin  35.17 
 
 		 266 aa  60.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.719479 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1453  muramidase  33.79 
 
 		 239 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0618214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1654  glycoside hydrolase family 24  31.78 
 
 		 227 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00139  endolysin  49.23 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2297  glycoside hydrolase family 24  29.09 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4318  glycoside hydrolase family protein  24.52 
 
 		 243 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1543  glycoside hydrolase family 24  27.21 
 
 		 237 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3701  family 24 glycoside hydrolase  30.86 
 
 		 225 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1004  glycoside hydrolase family protein  29.5 
 
 		 244 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.974196 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  41.33 
 
 		 968 aa  42  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0566  hypothetical protein  41.67 
 
 		 252 aa  41.6  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4117  putative transmembrane protein  33.81 
 
 		 200 aa  40.8  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.156903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>