38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0937 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  100 
 
 		 222 aa  458  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  69.42 
 
 		 207 aa  295  4e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18641  endolysin  72.26 
 
 		 194 aa  244  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1047  muramidase  59.62 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0905977  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15601  endolysin  59.35 
 
 		 266 aa  188  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.719479 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1453  muramidase  56.88 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0618214 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1613  lysozyme  39.71 
 
 		 158 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.875614  hitchhiker  0.00136066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  38.69 
 
 		 158 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10030  cell lysis protein  35.58 
 
 		 158 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.011177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00728  hypothetical protein  35.58 
 
 		 158 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00935767  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2276  lysozyme  38.24 
 
 		 158 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00766878  hitchhiker  1.42848e-18 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0209  hypothetical protein  33.13 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0202291  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  40.77 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2206  lysozyme  32.21 
 
 		 630 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1700  bacteriophage endolysin protein  36.81 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3944  muramidase (phage lambda lysozyme)-like  37.1 
 
 		 347 aa  72.4  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  37.86 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1848  putative bacteriophage endolysin protein  35.03 
 
 		 163 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0252  lysozyme  37.21 
 
 		 96 aa  61.2  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2511  Lysozyme  33.56 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2416  glycoside hydrolase family protein  32.45 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4117  putative transmembrane protein  39.81 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1526  Lysozyme  30.38 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1852  glycoside hydrolase family protein  34.13 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0259266  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2297  glycoside hydrolase family 24  32.16 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3045  phage lysozyme  29.8 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011142 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1654  glycoside hydrolase family 24  30 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4330  phage lysozyme  29.8 
 
 		 165 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4318  glycoside hydrolase family protein  28.99 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1004  glycoside hydrolase family protein  30.22 
 
 		 244 aa  52  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.974196 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3701  family 24 glycoside hydrolase  29.21 
 
 		 225 aa  52  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3521  putative transmembrane protein  40.96 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1808  putative transmembrane protein  34.06 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.849383  hitchhiker  0.00211486 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1543  glycoside hydrolase family 24  28.78 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2111  Lysozyme  28.48 
 
 		 163 aa  48.5  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0566  hypothetical protein  40.48 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00141  hypothetical protein  44.07 
 
 		 76 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.194943  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1636  putative transmembrane protein  37.18 
 
 		 271 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>