19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1543 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1543  glycoside hydrolase family 24  100 
 
 
237 aa  494  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1654  glycoside hydrolase family 24  51.57 
 
 
227 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2297  glycoside hydrolase family 24  58.93 
 
 
204 aa  208  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4318  glycoside hydrolase family protein  45.58 
 
 
243 aa  195  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77437  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3701  family 24 glycoside hydrolase  48.54 
 
 
225 aa  194  9e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1004  glycoside hydrolase family protein  53.85 
 
 
244 aa  185  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.974196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3944  muramidase (phage lambda lysozyme)-like  32.5 
 
 
347 aa  72.4  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  31.68 
 
 
207 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2206  lysozyme  24.81 
 
 
630 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  30.6 
 
 
179 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  28.78 
 
 
222 aa  48.9  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  27.2 
 
 
161 aa  48.9  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0209  hypothetical protein  25.9 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0202291  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18641  endolysin  33.33 
 
 
194 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1047  muramidase  30.53 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0905977  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1852  glycoside hydrolase family protein  28.48 
 
 
150 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0259266  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15601  endolysin  33.33 
 
 
266 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.719479 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  23.44 
 
 
158 aa  42.4  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1700  bacteriophage endolysin protein  22.66 
 
 
163 aa  42  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0709181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>