31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2206 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2206  lysozyme  100 
 
 		 630 aa  1283    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4009  hypothetical protein  50.16 
 
 		 548 aa  306  9.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  41.84 
 
 		 161 aa  104  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  42.45 
 
 		 158 aa  100  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2276  lysozyme  43.51 
 
 		 158 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00766878  hitchhiker  1.42848e-18 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10030  cell lysis protein  41.73 
 
 		 158 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.011177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00728  hypothetical protein  41.73 
 
 		 158 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00935767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1613  lysozyme  42.75 
 
 		 158 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.875614  hitchhiker  0.00136066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1848  putative bacteriophage endolysin protein  39.16 
 
 		 163 aa  90.9  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166083  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1700  bacteriophage endolysin protein  34.27 
 
 		 163 aa  87.8  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2511  Lysozyme  36.88 
 
 		 162 aa  87.8  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3045  phage lysozyme  37.33 
 
 		 165 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4330  phage lysozyme  37.33 
 
 		 165 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664244 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  36.36 
 
 		 207 aa  85.9  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18641  endolysin  33.15 
 
 		 194 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3854  endolysin  38.17 
 
 		 179 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2111  Lysozyme  38.19 
 
 		 163 aa  81.3  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0193492  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3944  muramidase (phage lambda lysozyme)-like  35.38 
 
 		 347 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2416  glycoside hydrolase family protein  35 
 
 		 173 aa  77.8  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  32.21 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1526  Lysozyme  37.14 
 
 		 163 aa  76.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1047  muramidase  33.57 
 
 		 224 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0905977  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0209  hypothetical protein  32.21 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0202291  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15601  endolysin  31.94 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.719479 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1453  muramidase  31.03 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0618214 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1852  glycoside hydrolase family protein  34.29 
 
 		 150 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0259266  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0252  lysozyme  42.86 
 
 		 96 aa  62.4  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1543  glycoside hydrolase family 24  24.81 
 
 		 237 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1654  glycoside hydrolase family 24  28.95 
 
 		 227 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4318  glycoside hydrolase family protein  31.76 
 
 		 243 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0566  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>