24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4009 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4009  hypothetical protein  100 
 
 
548 aa  1106    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2206  lysozyme  50.16 
 
 
630 aa  306  8.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2251  putative bacteriophage protein  53.6 
 
 
632 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1043  hypothetical protein  43.88 
 
 
606 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.8716 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3119  hypothetical protein  45.54 
 
 
648 aa  97.1  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1113  hypothetical protein  25.42 
 
 
684 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143488  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1462  hypothetical protein  37.9 
 
 
142 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214216  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2757  hypothetical protein  37.9 
 
 
142 aa  87.8  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.434838 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2940  prophage MuMc02, structural protein P5  41.03 
 
 
141 aa  79  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2357  hypothetical protein  39.83 
 
 
140 aa  77.4  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187401  unclonable  0.0000000174557 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2202  hypothetical protein  37.58 
 
 
207 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0262907  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1356  hypothetical protein  36.64 
 
 
145 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222936  normal  0.255743 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1787  structural protein P5, putative  38.33 
 
 
138 aa  75.1  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122678  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1664  hypothetical protein  37.39 
 
 
135 aa  72.8  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3951  hypothetical protein  36.84 
 
 
148 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1633  hypothetical protein  36.67 
 
 
138 aa  72  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3921  hypothetical protein  37.4 
 
 
145 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886022  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4096  hypothetical protein  35.25 
 
 
149 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3360  hypothetical protein  33.81 
 
 
149 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1583  structural protein P5, putative  35.61 
 
 
158 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.326699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0573  TP901 family phage tail tape measure protein  28.57 
 
 
1543 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0790  hypothetical protein  31.93 
 
 
270 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1573  hypothetical protein  38.1 
 
 
415 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.864803  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1875  putative membrane protein, phage K related  24.59 
 
 
600 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855752  hitchhiker  0.000000000791061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>