19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0573 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0573  TP901 family phage tail tape measure protein  100 
 
 		 1543 aa  3040    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4127  TP901 family phage tail tape measure protein  36.2 
 
 		 1414 aa  504  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.221836  normal  0.191651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5175  TP901 family phage tail tape measure protein  34.92 
 
 		 1152 aa  225  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4009  hypothetical protein  26.92 
 
 		 548 aa  59.3  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2357  hypothetical protein  34.51 
 
 		 140 aa  56.2  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187401  unclonable  0.0000000174557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1583  structural protein P5, putative  34.69 
 
 		 158 aa  53.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.326699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3360  hypothetical protein  33.78 
 
 		 149 aa  52.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2451  hypothetical protein  33.67 
 
 		 1088 aa  52.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3951  hypothetical protein  33.11 
 
 		 148 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4096  hypothetical protein  33.11 
 
 		 149 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2940  prophage MuMc02, structural protein P5  34.15 
 
 		 141 aa  50.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0888  TP901 family phage tail tape measure protein  24.03 
 
 		 757 aa  50.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.322682  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2251  putative bacteriophage protein  32.79 
 
 		 632 aa  48.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3921  hypothetical protein  32.43 
 
 		 145 aa  46.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1664  hypothetical protein  36.07 
 
 		 135 aa  46.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1633  hypothetical protein  30.99 
 
 		 138 aa  46.2  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1356  hypothetical protein  31.08 
 
 		 145 aa  45.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222936  normal  0.255743 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3119  hypothetical protein  27.35 
 
 		 648 aa  45.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1787  structural protein P5, putative  31.21 
 
 		 138 aa  45.1  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122678  normal  0.856291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>