20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2357 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2357  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  286  6e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187401  unclonable  0.0000000174557 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1787  structural protein P5, putative  73.72 
 
 
138 aa  208  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122678  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1633  hypothetical protein  72.26 
 
 
138 aa  205  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1664  hypothetical protein  51.49 
 
 
135 aa  133  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1583  structural protein P5, putative  45.52 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.326699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3951  hypothetical protein  46.21 
 
 
148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3360  hypothetical protein  44.14 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4096  hypothetical protein  44.14 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1462  hypothetical protein  44.76 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214216  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2757  hypothetical protein  49.19 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.434838 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2202  hypothetical protein  43.94 
 
 
207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0262907  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1356  hypothetical protein  41.96 
 
 
145 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222936  normal  0.255743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3921  hypothetical protein  41.96 
 
 
145 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886022  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2940  prophage MuMc02, structural protein P5  49.57 
 
 
141 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2251  putative bacteriophage protein  36.72 
 
 
632 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4009  hypothetical protein  39.83 
 
 
548 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3119  hypothetical protein  32.82 
 
 
648 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1043  hypothetical protein  34.23 
 
 
606 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.8716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0573  TP901 family phage tail tape measure protein  34.51 
 
 
1543 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1113  hypothetical protein  32.08 
 
 
684 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143488  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>